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http://hdl.handle.net/1843/52525
Type: | Artigo de Periódico |
Title: | Virtual screening of adenylate kinase 3 inhibitors employing pharmacophoric model, molecular docking, and molecular dynamics simulations as potential therapeutic target in chronic lymphocytic leukemia |
Other Titles: | Triagem virtual de inibidores da adenilato quinase 3 empregando modelo farmacofórico, docking molecular e simulações de dinâmica molecular como potencial alvo terapêutico na leucemia linfocítica crônica |
Authors: | Bárbara Lima Fonseca Barbosa Tulio Resende Freitas Michell de Oliveira Almeida Sérgio Schusterschitz da Silva Araújo Ana Clara Andrade Geovana Gomes Dornelas Julyana Gayva Fiorotto Vinicius Gonçalves Maltarollo Adriano de Paula Sabino |
Abstract: | Adenylate kinase 3 (AK3) is an enzyme located in the mitochondrial matrix involved in purine homeostasis. This protein has been considered a potential therapeutic target in chronic lymphocytic leukemia (CLL), because the silencing of the AK3 gene has inhibited cell growth in CLL in vitro models. This study aimed to design potential AK3 inhibitors by applying molecular modeling techniques. Through the mapping of AK3 binding sites, essential interaction fields for pharmacophore design were identified. Online libraries were virtually screened by using a pharmacophore model, and 6891 compounds exhibited the functional groups for interaction with the target. These compounds underwent molecular docking simulations through Surflex and GOLD programs. After visual inspection, we selected 13 compounds for pharmacokinetic properties toxicology prediction via admetSAR and Protox web servers. Finally, six compounds were chosen for further analysis. |
Abstract: | A adenilato quinase 3 (AK3) é uma enzima localizada na matriz mitocondrial envolvida na homeostase das purinas. Essa proteína tem sido considerada um potencial alvo terapêutico na leucemia linfocítica crônica (LLC), pois o silenciamento do gene AK3 inibiu o crescimento celular em modelos in vitro de LLC. Este estudo teve como objetivo projetar potenciais inibidores de AK3 por meio da aplicação de técnicas de modelagem molecular. Por meio do mapeamento dos sítios de ligação de AK3, foram identificados campos de interação essenciais para o desenho de farmacóforos. As bibliotecas on-line foram virtualmente rastreadas usando um modelo de farmacóforo e 6891 compostos exibiram os grupos funcionais para interação com o alvo. Esses compostos passaram por simulações de docking molecular através dos programas Surflex e GOLD. Após inspeção visual, selecionamos 13 compostos para predição de toxicologia de propriedades farmacocinéticas via servidores web admetSAR e Protox. Por fim, seis compostos foram escolhidos para posterior análise. |
Subject: | Leucemia linfocítica crônica de células B Adenilato quinase Desenho de fármacos Farmacóforo |
language: | eng |
metadata.dc.publisher.country: | Brasil |
Publisher: | Universidade Federal de Minas Gerais |
Publisher Initials: | UFMG |
metadata.dc.publisher.department: | FAR - DEPARTAMENTO DE ANÁLISES CLÍNICAS E TOXICOLÓGICAS FAR - DEPARTAMENTO DE PRODUTOS FARMACÊUTICOS HCL - HOSPITAL DAS CLINICAS |
Rights: | Acesso Aberto |
metadata.dc.identifier.doi: | https://doi.org/10.3390/futurepharmacol1010006 |
URI: | http://hdl.handle.net/1843/52525 |
Issue Date: | 3-Dec-2021 |
metadata.dc.url.externa: | https://www.mdpi.com/2673-9879/1/1/6 |
metadata.dc.relation.ispartof: | Future Pharmacology |
Appears in Collections: | Artigo de Periódico |
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