Phylogenomics and diversification of the Schistosomatidae based on targeted sequence capture of ultra-conserved elements

Abstract

Schistosomatidae Stiles e Hassall 1898 é uma família clinicamente significativa de trematódeos digenéticos (Trematoda: Digenea), cujos membros infectam mamíferos ou aves como hospedeiros definitivos e gastrópodes aquáticos ou anfíbios como hospedeiros intermediários. Atualmente, existem 17 gêneros nomeados, para muitos dos quais as inter-relações evolutivas permanecem sem solução. A falta de uma filogenia resolvida dificultou a nossa compreensão da evolução dos esquistossomatídeos, especificamente dos padrões de uso de hospedeiros e do papel da troca de hospedeiros na diversificação. Aqui, usamos a captura de sequência direcionada de elementos ultraconservados (UCEs) de representantes de 13 dos 17 gêneros nomeados e 11 linhagens não descritas que se presume representarem novos gêneros ou espécies para gerar um conjunto de dados filogenômicos para a estimativa de inter-relações de esquistossomatídeos. Este estudo representa o maior esforço filogenético dentro dos Schistosomatidae tanto no número de loci quanto na amplitude da amostragem do táxon. Apresentamos uma filogenia quase abrangente em nível de família, fornecendo resolução para vários clados de incerteza de longa data dentro de Schistosomatidae, incluindo resolução para a localização dos esquistossomas mamíferos norte-americanos, implicando uma segunda captura separada de hospedeiros mamíferos. Adicionalmente, apresentamos evidências da colocação de Macrobilharzia na base da radiação Schistosoma + Bivitellobilharzia. Padrões de uso de hospedeiros definitivos e intermediários e um forte papel para a troca de hospedeiros intermediários são discutidos em relação à diversificação dos esquistossomatídeos.