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http://hdl.handle.net/1843/40332
Type: | Artigo de Periódico |
Title: | Flow cytometric-based protocols for assessing anti-mt-2 igg1 reactivity: high-dimensional data handling to define predictors for clinical follow-up of human t-cell leukemia virus type-1 infection |
Other Titles: | Protocolos baseados em citometria de fluxo para avaliar a reatividade anti-mt-2 igg1: manipulação de dados de alta dimensão para definir preditores para acompanhamento clínico da infecção pelo vírus da leucemia de células T humanas tipo 1 |
Authors: | Jordana Grazzielacoelho-dos-reis João Gabriel Ribas Denise Utsch Gonçalves Anna Bárbara de Freitas Carneiro-proietti Andréa Teixeira-carvalho Olindo Assis Martins-filho Vanessa Peruhype-magalhães Marcelo Antônio Pascoal-xavier Matheus de Souza Gomes Laurence Rodrigues do Amaral Ludmila Melo Cardoso Juan Jonathan-gonçalves Ágata Lopes Ribeiro Ana Lúcia Borges Starling |
Abstract: | The present work provides an innovative methodological approach to assess the anti-HTLV-1 IgG1 reactivity with practical application in clinical laboratory. Serum from non-infected healthy controls (NI) and HTLV-1-infected patients, categorized as asymptomatic (AS), putatively progressing to HTLV-1 associated myelopathy/tropical spastic paraparesis - HAM/TSP (pHAM) or with clinical diagnosis of HAM/TSP (HT) were assayed in two-parallel flow cytometry platforms, referred as: Fix and Fix&Perm protocols. Operating-characteristics analysis indicated that a single pair of attributes ("serum dilution/cut-off") for Fix and Fix&Perm protocols presented excellent performance for the diagnosis of HTLV-1 infection. Conversely, Fix and Fix&Perm protocols displayed weak/moderate overall performances when applied with prognosis purposes of HTLV-1 infection. A panoramic snapshot provided by the reactivity boards revealed clearly the higher sensitivity of Fix&Perm protocol for detecting seropositivity for HT, suggesting that stepwise combinatory criteria would improve the global performance of using a single pair of attributes. Three data mining strategies were tested, including endpoint titer analysis, heatmap assemblage and decision tree analysis. Bi-dimensional heatmap analysis demonstrated that, while the clustering profile of NI vs HTLV-1+ revealed segregation in opposite poles, AS vs HT presented discrete segregation but still displaying an intertwined distribution pattern. The combination of methods for segregating AS from HT displayed a moderate but superior global accuracy (85.7%; LOOCV=71.4%). The comprehensive data analysis support that the combination of methods have improved the performance to the differential diagnosis of AS and HT, with direct association with laboratorial records, including serum cytokine levels and proviral load. |
Abstract: | O presente trabalho fornece uma abordagem metodológica inovadora para avaliar a reatividade anti-HTLV-1 IgG1 com aplicação prática em laboratório clínico. Soro de controles saudáveis não infectados (NI) e pacientes infectados pelo HTLV-1, categorizados como assintomáticos (AS), com progressão putativa para mielopatia associada ao HTLV-1/paraparesia espástica tropical - HAM/TSP (pHAM) ou com diagnóstico clínico de HAM /TSP (HT) foram ensaiados em duas plataformas de citometria de fluxo paralelas, denominadas: Protocolos Fix e Fix&Perm. A análise das características operacionais indicou que um único par de atributos ("diluição/cut-off do soro") para os protocolos Fix e Fix&Perm apresentou excelente desempenho para o diagnóstico da infecção pelo HTLV-1. Por outro lado, os protocolos Fix e Fix&Perm apresentaram desempenho geral fraco/moderado quando aplicados com propósitos de prognóstico de infecção por HTLV-1. Um instantâneo panorâmico fornecido pelas placas de reatividade revelou claramente a maior sensibilidade do protocolo Fix&Perm para detectar soropositividade para HT, sugerindo que critérios combinatórios passo a passo melhorariam o desempenho global do uso de um único par de atributos. Três estratégias de mineração de dados foram testadas, incluindo análise de título de endpoint, montagem de mapa de calor e análise de árvore de decisão. A análise do mapa de calor bidimensional demonstrou que, enquanto o perfil de agrupamento de NI vs HTLV-1+ revelou segregação em polos opostos, AS vs HT apresentou segregação discreta, mas ainda exibindo um padrão de distribuição entrelaçado. A combinação de métodos para segregar AS do HT apresentou uma acurácia global moderada, porém superior (85,7%; LOOCV=71,4%). A análise abrangente dos dados sustenta que a combinação de métodos melhorou o desempenho para o diagnóstico diferencial de EA e TH, com associação direta com registros laboratoriais, incluindo níveis séricos de citocinas e carga proviral. |
Subject: | Imunologia HAM/TSP HTLV-1 Citometria de fluxo Acompanhamento clínico |
language: | eng |
metadata.dc.publisher.country: | Brasil |
Publisher: | Universidade Federal de Minas Gerais |
Publisher Initials: | UFMG |
metadata.dc.publisher.department: | ICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA MED - DEPARTAMENTO DE ANATOMIA PATOLÓGICA E MEDICINA LEGAL MED - DEPARTAMENTO DE OFTALMOLOGIA E OTORRINOLARINGOLOGIA |
Rights: | Acesso Restrito |
metadata.dc.identifier.doi: | 10.1016/j.jim.2017.02.006 |
URI: | http://hdl.handle.net/1843/40332 |
Issue Date: | 2017 |
metadata.dc.url.externa: | https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0022175916303404?via%3Dihub |
metadata.dc.relation.ispartof: | Journal of immunological methods |
Appears in Collections: | Artigo de Periódico |
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