1. Repositório Institucional da UFMG
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  3. Artigo de Periódico
Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1843/42505
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DC FieldValueLanguage
dc.creatorAlessandra Rejane Ericsson de Oliveira Xavierpt_BR
dc.creatorAngélica Alves de Moura Freitaspt_BR
dc.creatorAnna Christina de Almeidapt_BR
dc.creatorVasco Ariston de Carvalho Azevedopt_BR
dc.creatorIgor Viana Brandipt_BR
dc.date.accessioned2022-06-14T14:46:26Z-
dc.date.available2022-06-14T14:46:26Z-
dc.date.issued2016-
dc.citation.volume8pt_BR
dc.citation.issue2pt_BR
dc.citation.spage23pt_BR
dc.citation.epage29pt_BR
dc.identifier.issn2447-6218pt_BR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/1843/42505-
dc.description.abstractThe genetic characterization of species is essential when you want to elect a vaccine strain or control the spread of outbreaks of a disease in a region. The 16S rRNA and pld Corynebacterium pseudotuberculosis genes play an important role as markers for bacterial genotype identification. The aim of this study was to validate an “in house” molecular methodology for genetic identification of Corynebacterium spp. isolated from clinical samples maintained in the laboratory. For this purpose, eleven isolates were reactivated in Brain Heart Infusion broth. The grown colonies identified as Gram-positive bacilli were submitted to chromosomal DNA extraction with KAPAExtract® kit according to manufacturer's recommendations. The extracted chromosomal DNA was quantified by 1.5% agarose gel electrophoresis and then subjected to duplex PCR with specific primers for the genus and species of Corynebacterium pseudotuberculosis. The amplicons generated were analyzed by 2.0% agarose gel electrophoresis. None of the isolated amplified the target genes for genus and specific species for those expected to be C. pseudotuberculosis. The positive control, C. pseudotuberculosis CIP102968 amplified fragments of 813 and 201 base pairs which corresponding to the 16S rRNA (genus specific) and pld genes (species specific) respectively. The negative control, Escherichia coli ATCC® 25922 do not amplified any target genes as expected. The results showed the need for improvement in the sampling techniques and previous microbiological identification preceding the molecular identification step and they are extremely important for precise genotype identification of strains of C. pseudotuberculosis.pt_BR
dc.description.resumoA caracterização genética das espécies é essencial quando se deseja eleger uma estirpe vacinal ou controlar a propagação de focos de uma doença em uma região. O 16S rRNA e genes que codificam phospolipase D (PLD) de Corynebacterium pseudotuberculosis desempenham um papel importante como marcadores para identificação de genótipo bacteriano. O objetivo deste estudo foi validar um “in house” metodologia molecular para identificação genética de Corynebacterium spp. isolado a partir de amostras clínicas mantidos em laboratório. Para este efeito, onze isolados foram reativados em caldo de infusão de cérebro e coração. As colônias cultivadas identificados como bacilos Gram-posi-tivas foram submetidas à extração do DNA cromossômico com kit KAPAExtract® de acordo com as recomendações do fabricante. O DNA cromossômico extraído foi quantificado por eletroforese em gel de agarose a 1,5% e, em seguida, submetidos a PCR duplex com os iniciadores específicos para o gênero e espécie de Corynebacterium pseudotuberculosis. Os produtos de amplificação gerados foram analisados por eletroforese em gel de agarose a 2,0%. Nenhum dos isolados amplificou os genes-al-vo para gênero e espécie específicos esperados para C. pseudotuberculosis. O controlo positivo, C. pseudotuberculosis CIP102968, teve os fragmentos de 813 e 201 pares de bases que correspondem aos 16S rRNA genes (gênero específico) e PLD (espécies específicas), respectivamente, amplificado. O controlo negativo, Escherichia coli ATCC 25922 não amplificado quaisquer genes alvo como espera-do. Os resultados mostraram a necessidade de melhoria nas técnicas de amostragem e identificação microbiológica anterior que antecede a etapa de identificação molecular e eles são extremamente im-portantes para a identificação do genótipo preciso de cepas de C. pseudotuberculosis.pt_BR
dc.description.sponsorshipOutra Agênciapt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Geraispt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentICA - INSTITUTO DE CIÊNCIAS AGRÁRIASpt_BR
dc.publisher.initialsUFMGpt_BR
dc.relation.ispartofCaderno de Ciências Agrárias - UFMGpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subject.otherLinfadenite caseosapt_BR
dc.subject.otherFosfolipasespt_BR
dc.titleGenes 16s RNA ribossomal e pld como marcadores moleculares para identificação genotípica de amostras clínicas de Corynebacterium spp.pt_BR
dc.title.alternativeThe 16S ribosomal RNA and pld genes as molecular marker to genotyping identification of Corynebacterium spp. isolated from clinical samplespt_BR
dc.typeArtigo de Periódicopt_BR
dc.url.externahttps://periodicos.ufmg.br/index.php/ccaufmg/article/view/2907pt_BR
dc.identifier.orcidhttps://orcid.org/ 0000-0001-9836-4117pt_BR
dc.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-6714-7996pt_BR
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Genes 16S RNA ribossomal e pld como marcadores moleculares para identificação genotípica de amostras clínicas de Corynebacterium spp..pdf1.02 MBAdobe PDFView/Open
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