Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1843/44817
Type: Artigo de Periódico
Title: Development and validation of rt-qpcr for vesicular stomatitis virus detection (Alagoas vesiculovirus)
Other Titles: Desenvolvimento e validação do rt-qpcr para detecção do vírus da estomatite vesicular (Alagoas vesiculovirus)
Authors: Anapolino Macedode Oliveira
Cristiano Barros de Melo
Antônio Augusto Fonseca
Marcelo Fernandes Camargos
Lívia Maria Orzil
Mateus Laguardia Nascimento
Anna Gabriella Guimarães Oliveira
Jacqueline Gomes Rodrigues
Mariana Lázaro Sales
Tatiana Flávia Pinheiro de Oliveira
Abstract: Vesicular stomatitis is an infectious disease that occurs mainly in countries of the Western Hemisphere and affects cattle, swine and horses. The clinical symptoms in cattle and swine are similar to foot-and-mouth disease and include vesicular ulceration of the tongue and mouth. The disease requires a rapid and accurate differential diagnosis, aiming for immediate implementation of control measures. The objective of the present study was to develop and perform validation tests of multiplex RT-qPCR(s) for the detection of RNA from Alagoas vesiculovirus, considering the parameters of sensitivity and analytical specificity, analytical performance (repeatability and reproducibility criteria) and the uncertainty of the measurement. The threshold cycle values obtained in triplicate from each sample were evaluated by considering the variations between days, analysts and equipment in an analysis of variance aimed at determining the variances of repeatability and reproducibility. The results showed that RT-qPCRs had excellent sensitivity and specificity in the detection of RNA of the Alagoas vesiculovirus. The validation parameters showed low coefficients of variation and were equivalent to those found in other validation studies, indicating that the tests presented excellent repeatability and reproducibility.
Abstract: A estomatite vesicular é uma doença infecciosa que ocorre principalmente em países do Hemisfério Ocidental e afeta bovinos, suínos e equinos. Os sintomas clínicos em bovinos e suínos são semelhantes à febre aftosa e incluem ulceração vesicular da língua e da boca. A doença requer um diagnóstico diferencial rápido e preciso, visando a implementação imediata de medidas de controle. O objetivo do presente estudo foi desenvolver e realizar testes de validação de RT-qPCR(s) multiplex para detecção de RNA de vesiculovírus de Alagoas, considerando os parâmetros de sensibilidade e especificidade analítica, desempenho analítico (critérios de repetibilidade e reprodutibilidade) e a incerteza da medição. Os valores do ciclo limiar obtidos em triplicata de cada amostra foram avaliados considerando as variações entre dias, analistas e equipamentos em uma análise de variância visando determinar as variâncias de repetibilidade e reprodutibilidade. Os resultados mostraram que os RT-qPCRs apresentaram excelente sensibilidade e especificidade na detecção do RNA do vesiculovírus de Alagoas. Os parâmetros de validação apresentaram baixos coeficientes de variação e foram equivalentes aos encontrados em outros estudos de validação, indicando que os testes apresentaram excelente repetibilidade e reprodutibilidade.
Subject: PCR
Alagoas vesiculovirus
Validação
language: eng
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: Universidade Federal de Minas Gerais
Publisher Initials: UFMG
metadata.dc.publisher.department: ICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS
Rights: Acesso Restrito
metadata.dc.identifier.doi: 10.1016/j.jviromet.2018.03.011
URI: http://hdl.handle.net/1843/44817
Issue Date: 2018
metadata.dc.url.externa: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S016609341730602X
metadata.dc.relation.ispartof: Journal of Virological Methods
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