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http://hdl.handle.net/1843/44817
Type: | Artigo de Periódico |
Title: | Development and validation of rt-qpcr for vesicular stomatitis virus detection (Alagoas vesiculovirus) |
Other Titles: | Desenvolvimento e validação do rt-qpcr para detecção do vírus da estomatite vesicular (Alagoas vesiculovirus) |
Authors: | Anapolino Macedode Oliveira Cristiano Barros de Melo Antônio Augusto Fonseca Marcelo Fernandes Camargos Lívia Maria Orzil Mateus Laguardia Nascimento Anna Gabriella Guimarães Oliveira Jacqueline Gomes Rodrigues Mariana Lázaro Sales Tatiana Flávia Pinheiro de Oliveira |
Abstract: | Vesicular stomatitis is an infectious disease that occurs mainly in countries of the Western Hemisphere and affects cattle, swine and horses. The clinical symptoms in cattle and swine are similar to foot-and-mouth disease and include vesicular ulceration of the tongue and mouth. The disease requires a rapid and accurate differential diagnosis, aiming for immediate implementation of control measures. The objective of the present study was to develop and perform validation tests of multiplex RT-qPCR(s) for the detection of RNA from Alagoas vesiculovirus, considering the parameters of sensitivity and analytical specificity, analytical performance (repeatability and reproducibility criteria) and the uncertainty of the measurement. The threshold cycle values obtained in triplicate from each sample were evaluated by considering the variations between days, analysts and equipment in an analysis of variance aimed at determining the variances of repeatability and reproducibility. The results showed that RT-qPCRs had excellent sensitivity and specificity in the detection of RNA of the Alagoas vesiculovirus. The validation parameters showed low coefficients of variation and were equivalent to those found in other validation studies, indicating that the tests presented excellent repeatability and reproducibility. |
Abstract: | A estomatite vesicular é uma doença infecciosa que ocorre principalmente em países do Hemisfério Ocidental e afeta bovinos, suínos e equinos. Os sintomas clínicos em bovinos e suínos são semelhantes à febre aftosa e incluem ulceração vesicular da língua e da boca. A doença requer um diagnóstico diferencial rápido e preciso, visando a implementação imediata de medidas de controle. O objetivo do presente estudo foi desenvolver e realizar testes de validação de RT-qPCR(s) multiplex para detecção de RNA de vesiculovírus de Alagoas, considerando os parâmetros de sensibilidade e especificidade analítica, desempenho analítico (critérios de repetibilidade e reprodutibilidade) e a incerteza da medição. Os valores do ciclo limiar obtidos em triplicata de cada amostra foram avaliados considerando as variações entre dias, analistas e equipamentos em uma análise de variância visando determinar as variâncias de repetibilidade e reprodutibilidade. Os resultados mostraram que os RT-qPCRs apresentaram excelente sensibilidade e especificidade na detecção do RNA do vesiculovírus de Alagoas. Os parâmetros de validação apresentaram baixos coeficientes de variação e foram equivalentes aos encontrados em outros estudos de validação, indicando que os testes apresentaram excelente repetibilidade e reprodutibilidade. |
Subject: | PCR Alagoas vesiculovirus Validação |
language: | eng |
metadata.dc.publisher.country: | Brasil |
Publisher: | Universidade Federal de Minas Gerais |
Publisher Initials: | UFMG |
metadata.dc.publisher.department: | ICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS |
Rights: | Acesso Restrito |
metadata.dc.identifier.doi: | 10.1016/j.jviromet.2018.03.011 |
URI: | http://hdl.handle.net/1843/44817 |
Issue Date: | 2018 |
metadata.dc.url.externa: | https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S016609341730602X |
metadata.dc.relation.ispartof: | Journal of Virological Methods |
Appears in Collections: | Artigo de Periódico |
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