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http://hdl.handle.net/1843/51300
Type: | Artigo de Periódico |
Title: | Comparative genomics of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 8 reveals the importance of prophages in the genetic variability of the species |
Other Titles: | Genômica comparativa de Actinobacillus pleuropneumoniae sorotipo 8 revela a importância dos profagos na variabilidade genética da espécie |
Authors: | Isabelle Gonçalves de Oliveira Prado Giarlã Cunha da Silva Josicelli Souza Crispim Pedro Marcus Pereira Vidigal Moysés Nascimento Mateus Ferreira Santana Denise Mara Soares Bazzolli |
Abstract: | Actinobacillus pleuropneumoniae is the etiologic agent of porcine pleuropneumonia. Currently, there are 18 different serotypes; the serotype 8 is the most widely distributed in the United States, Canada, United Kingdom, and southeastern Brazil. In this study, genomes of seven A. pleuropneumoniae serotype 8 clinical isolates were compared to the other genomes of twelve serotypes. The analyses of serotype 8 genomes resulted in a set of 2352 protein-coding sequences. Of these sequences, 76.6% are present in all serotypes, 18.5% are shared with some serotypes, and 4.9% were differential. This differential portion was characterized as a series of hypothetical and regulatory protein sequences: mobile element sequence. Synteny analysis demonstrated possible events of gene recombination and acquisition by horizontal gene transfer (HGT) in this species. A total of 30 sequences related to prophages were identified in the genomes. These sequences represented 0.3 to 3.5% of the genome of the strains analyzed, and 16 of them contained complete prophages. Similarity analysis between complete prophage sequences evidenced a possible HGT with species belonging to the family Pasteurellaceae. Thus, mobile genetic elements, such as prophages, are important components of the differential portion of the A. pleuropneumoniae genome and demonstrate a central role in the evolution of the species. This study represents the first study done to understand the genome of A. pleuropneumoniae serotype 8. |
Abstract: | Actinobacillus pleuropneumoniae é o agente etiológico da pleuropneumonia suína. Atualmente, existem 18 sorotipos diferentes; o sorotipo 8 é o mais amplamente distribuído nos Estados Unidos, Canadá, Reino Unido e sudeste do Brasil. Neste estudo, os genomas de sete isolados clínicos de A. pleuropneumoniae sorotipo 8 foram comparados com os outros genomas de doze sorotipos. As análises dos genomas do sorotipo 8 resultaram em um conjunto de 2.352 sequências codificadoras de proteínas. Dessas sequências, 76,6% estão presentes em todos os sorotipos, 18,5% são compartilhadas com alguns sorotipos e 4,9% foram diferenciais. Essa porção diferencial foi caracterizada como uma série de sequências de proteínas hipotéticas e regulatórias: sequência do elemento móvel. A análise de sintenia demonstrou possíveis eventos de recombinação gênica e aquisição por transferência horizontal de genes (HGT) nesta espécie. Um total de 30 sequências relacionadas a prófagos foram identificadas nos genomas. Essas sequências representavam de 0,3 a 3,5% do genoma das cepas analisadas, sendo que 16 delas continham prófagos completos. A análise de similaridade entre as sequências completas do prófago evidenciou um possível HGT com espécies pertencentes à família Pasteurellaceae. Assim, elementos genéticos móveis, como os prófagos, são componentes importantes da porção diferencial do genoma de A. pleuropneumoniae e demonstram um papel central na evolução da espécie. Este estudo representa o primeiro estudo feito para entender o genoma do sorotipo 8 de A. pleuropneumoniae. |
Subject: | Actinobacillus pleuropneumoniae Genoma bacteriano Sorogrupo Prófagos |
language: | eng |
metadata.dc.publisher.country: | Brasil |
Publisher: | Universidade Federal de Minas Gerais |
Publisher Initials: | UFMG |
metadata.dc.publisher.department: | COLTEC - COLEGIO TECNICO |
Rights: | Acesso Aberto |
metadata.dc.identifier.doi: | https://doi.org/10.1155/2020/9354204 |
URI: | http://hdl.handle.net/1843/51300 |
Issue Date: | 19-Feb-2020 |
metadata.dc.url.externa: | https://www.hindawi.com/journals/ijg/2020/9354204/ |
metadata.dc.relation.ispartof: | International Journal of Genomics |
Appears in Collections: | Artigo de Periódico |
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