Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/1843/53667| Type: | Artigo de Periódico |
| Title: | Characterization of a new multidrug-resistant brazilian K. pneumoniae isolate and 172 Klebsiella spp. sequenced strains: genomic island, multilocus sequence typing and capsule locus dataset |
| Other Titles: | Caracterização de um novo isolado brasileiro multirresistente de K. pneumoniae e 172 Klebsiella spp. cepas sequenciadas: ilha genômica, tipagem de sequência multilocus e conjunto de dados do locus da cápsula |
| Authors: | Rodrigo Profeta Silveira Santos Núbia Seyffert Sandeep Tiwari Marcus Vinicius Canário Viana Arun Kumar Jaiswal Ana Carolina Barbosa Caetano Daniel Henrique Bücker Luciana Tavares de Oliveira Roselane Gonçalves dos Santos Alfonso Gala García Rodrigo Bentes Kato Francine Ferreira Padilha Isabel Bezerra Lima-Verde Preetam Ghosh Debmalya Barh Aristóteles Góes Neto Henrique Cesar Pereira Figueiredo Siomar de Castro Soares Roberto José Meyer Nascimento Bertram Brenig Pablo Ivan Pereira Ramos Vasco Ariston de Carvalho Azevedo Thiago Luiz de Paula Castro |
| Abstract: | The genus Klebsiella comprises species that cause nosocomial and community-acquired infections. A dataset was created to compile the sequence type (ST) and capsule type (K-locus) information predicted for 172 worldwide isolates of Klebsiella spp. whose complete genomes could be retrieved from the GenBank (NCBI) repository. The dataset also includes information related to one multidrug-resistant strain (B31) isolated from a patient who was admitted to an intensive care unit in the Northeast region of Brazil. This strain was phenotypically characterized and submitted to wholegenome sequencing and comparative genomics analysis as we recently reported [1]. The dataset also compiles information on Pathogenicity Islands (PIs), Resistance Islands (RIs) and Miscellaneous Islands (MIS) present in the genome of strain B31. The information provided here may support outbreak prevention policies and future epidemiological studies involving Klebsiella spp. |
| Abstract: | O gênero Klebsiella compreende espécies que causam infecções nosocomiais e adquiridas na comunidade. Um conjunto de dados foi criado para compilar as informações do tipo de sequência (ST) e do tipo de cápsula (K-locus) previstas para 172 isolados mundiais de Klebsiella spp. cujos genomas completos podem ser recuperados do repositório GenBank (NCBI). O conjunto de dados também inclui informações relacionadas a uma cepa multirresistente (B31) isolada de um paciente internado em uma unidade de terapia intensiva na região Nordeste do Brasil. Esta cepa foi caracterizada fenotipicamente e submetida a sequenciamento de todo o genoma e análise genômica comparativa, como relatamos recentemente [1]. O conjunto de dados também compila informações sobre Ilhas de Patogenicidade (PIs), Ilhas de Resistência (RIs) e Ilhas Diversas (MIS) presentes no genoma da cepa B31. As informações fornecidas aqui podem apoiar políticas de prevenção de surtos e futuros estudos epidemiológicos envolvendo Klebsiella spp. |
| Subject: | Ilhas genômicas Tipagem de sequências multilocus Klebsiella pneumoniae Resistência microbiana a medicamentos Virulência |
| language: | eng |
| metadata.dc.publisher.country: | Brasil |
| Publisher: | Universidade Federal de Minas Gerais |
| Publisher Initials: | UFMG |
| metadata.dc.publisher.department: | HCL - HOSPITAL DAS CLINICAS ICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA ICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS VET - DEPARTAMENTO DE MEDICINA VETERINÁRIA PREVENTIVA |
| Rights: | Acesso Aberto |
| metadata.dc.identifier.doi: | https://doi.org/10.1016/j.dib.2021.106746 |
| URI: | http://hdl.handle.net/1843/53667 |
| Issue Date: | Feb-2021 |
| metadata.dc.url.externa: | https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340921000329?via%3Dihub |
| metadata.dc.relation.ispartof: | Data in Brief |
| Appears in Collections: | Artigo de Periódico |
Files in This Item:
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.