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http://hdl.handle.net/1843/58131
Type: | Monografia (especialização) |
Title: | Construção de modelo preditivo de imunogenicidade de neoepítopos: aplicação de métodos de aprendizado estatístico no desenvolvimento de imunoterápicos contra o câncer |
Authors: | Maria Gabriela Reis Carvalho |
First Advisor: | Rafael Santos Erbisti |
First Referee: | Jessica Quintanilha Kubrusly |
Second Referee: | Luiz Carlos Júnior Alcântara |
Abstract: | Este trabalho tem como objetivo principal contribuir com o desenvolvimento de novos imunoterápicos contra o câncer por meio do desenvolvimento e avaliação de modelos preditivos da capacidade de epítopos tumorais conduzirem à resposta imune efetiva. Um conjunto de 5.913 propriedades físico-químicas, estruturais e evolucionárias de sequências primárias de aminoácidos, consideradas potenciais preditoras da ativação das células TCD8+ foram empregadas na construção dos modelos. Modelos de regressão logística com penalização Lasso e Group-Lasso foram utilizadas para a seleção de um subconjunto ótimo de variáveis e os métodos de aprendizado estatístico XGBoost, Florestas Aleatórias (RF) e Máquinas de Vetores de Suporte (SVM) foram empregados para a classificação. Para o treinamento dos modelos, foi empregada a abordagem bootstrap com 1.000 amostras e, como métrica de desempenho, foram utilizados a Área Sob a Curva ROC (AUC), Sensibilidade e Especificidade. A análise dos modelos gerados permitiu verificar que, dentre os métodos de seleção de variáveis, o Group-Lasso foi aquele que apresentou melhor desempenho (AUC=0,6958). Dentre os modelos construídos com os diferentes métodos, a partir das variáveis selecionadas, aquele gerado com SVM apresentou um valor de AUC, igual a 0,8286, e Sensibilidade igual a 0,9078, tendo, portanto, um desempenho superior ao de modelos até então descritos na literatura. |
Subject: | Estatística Câncer Imunoterapia Aprendizado Estatístico Aprendizado do computador |
language: | por |
metadata.dc.publisher.country: | Brasil |
Publisher: | Universidade Federal de Minas Gerais |
Publisher Initials: | UFMG |
metadata.dc.publisher.department: | ICX - DEPARTAMENTO DE ESTATÍSTICA |
metadata.dc.publisher.program: | Curso de Especialização em Estatística |
Rights: | Acesso Restrito |
metadata.dc.rights.uri: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/pt/ |
URI: | http://hdl.handle.net/1843/58131 |
Issue Date: | 16-May-2023 |
metadata.dc.description.embargo: | 16-May-2025 |
Appears in Collections: | Especialização em Estatística |
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