Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1843/58131
Type: Monografia (especialização)
Title: Construção de modelo preditivo de imunogenicidade de neoepítopos: aplicação de métodos de aprendizado estatístico no desenvolvimento de imunoterápicos contra o câncer
Authors: Maria Gabriela Reis Carvalho
First Advisor: Rafael Santos Erbisti
First Referee: Jessica Quintanilha Kubrusly
Second Referee: Luiz Carlos Júnior Alcântara
Abstract: Este trabalho tem como objetivo principal contribuir com o desenvolvimento de novos imunoterápicos contra o câncer por meio do desenvolvimento e avaliação de modelos preditivos da capacidade de epítopos tumorais conduzirem à resposta imune efetiva. Um conjunto de 5.913 propriedades físico-químicas, estruturais e evolucionárias de sequências primárias de aminoácidos, consideradas potenciais preditoras da ativação das células TCD8+ foram empregadas na construção dos modelos. Modelos de regressão logística com penalização Lasso e Group-Lasso foram utilizadas para a seleção de um subconjunto ótimo de variáveis e os métodos de aprendizado estatístico XGBoost, Florestas Aleatórias (RF) e Máquinas de Vetores de Suporte (SVM) foram empregados para a classificação. Para o treinamento dos modelos, foi empregada a abordagem bootstrap com 1.000 amostras e, como métrica de desempenho, foram utilizados a Área Sob a Curva ROC (AUC), Sensibilidade e Especificidade. A análise dos modelos gerados permitiu verificar que, dentre os métodos de seleção de variáveis, o Group-Lasso foi aquele que apresentou melhor desempenho (AUC=0,6958). Dentre os modelos construídos com os diferentes métodos, a partir das variáveis selecionadas, aquele gerado com SVM apresentou um valor de AUC, igual a 0,8286, e Sensibilidade igual a 0,9078, tendo, portanto, um desempenho superior ao de modelos até então descritos na literatura.
Subject: Estatística
Câncer
Imunoterapia
Aprendizado Estatístico
Aprendizado do computador
language: por
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: Universidade Federal de Minas Gerais
Publisher Initials: UFMG
metadata.dc.publisher.department: ICX - DEPARTAMENTO DE ESTATÍSTICA
metadata.dc.publisher.program: Curso de Especialização em Estatística
Rights: Acesso Restrito
metadata.dc.rights.uri: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/pt/
URI: http://hdl.handle.net/1843/58131
Issue Date: 16-May-2023
metadata.dc.description.embargo: 16-May-2025
Appears in Collections:Especialização em Estatística

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