Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1843/72424
Type: Artigo de Periódico
Title: Evidence of Natural Hybridization in Brazilian Wild Lineages of Saccharomyces cerevisiae
Authors: Raquel Barbosa
Carlos Augusto Rosa
José Paulo Sampaio
Pedro Almeida
Silvana V. B. Safar
Renata Oliveira Santos
Paula B. Morais
Lou Nielly-Thibault
Jean-Baptiste Leducq
Christian R. Landry
Paula Gonçalves
Abstract: The natural biology of Saccharomyces cerevisiae, the best known unicellular model eukaryote, remains poorly documented and understood although recent progress has started to change this situation. Studies carried out recently in the Northern Hemisphere revealed the existence of wild populations associated with oak trees in North America, Asia, and in the Mediterranean region. However, in spite of these advances, the global distribution of natural populations of S. cerevisiae, especially in regions were oaks and other members of the Fagaceae are absent, is not well understood. Here we investigate the occurrence of S. cerevisiae in Brazil, a tropical region where oaks and other Fagaceae are absent. We report a candidate natural habitat of S. cerevisiae in South America and, using whole-genome data, we uncover new lineages that appear to have as closest relatives the wild populations found in North America and Japan. A population structure analysis revealed the penetration of the wine genotype into the wild Brazilian population, a first observation of the impact of domesticated microbe lineages on the genetic structure of wild populations. Unexpectedly, the Brazilian population shows conspicuous evidence of hybridization with an American population of Saccharomyces paradoxus. Introgressions from S. paradoxus were significantly enriched in genes encoding secondary active transmembrane transporters. We hypothesize that hybridization in tropical wild lineages may have facilitated the habitat transition accompanying the colonization of the tropical ecosystem.
Abstract: A biologia natural de Saccharomyces cerevisiae, o modelo eucariota unicelular mais conhecido, permanece pouco documentada e compreendida, embora progressos recentes tenham começado a mudar esta situação. Estudos realizados recentemente no Hemisfério Norte revelaram a existência de populações selvagens associadas aos carvalhos na América do Norte, na Ásia e na região do Mediterrâneo. No entanto, apesar destes avanços, a distribuição global das populações naturais de S. cerevisiae, especialmente em regiões onde os carvalhos e outros membros das Fagaceae estão ausentes, não é bem compreendida. Aqui investigamos a ocorrência de S. cerevisiae no Brasil, uma região tropical onde carvalhos e outras Fagaceae estão ausentes. Relatamos um candidato a habitat natural de S. cerevisiae na América do Sul e, usando dados do genoma completo, descobrimos novas linhagens que parecem ter como parentes mais próximos as populações selvagens encontradas na América do Norte e no Japão. Uma análise da estrutura populacional revelou a penetração do genótipo do vinho na população selvagem brasileira, uma primeira observação do impacto das linhagens de micróbios domesticados na estrutura genética das populações selvagens. Inesperadamente, a população brasileira apresenta evidências de hibridização com uma população americana de Saccharomyces paradoxus. As introgressões de S. paradoxus foram significativamente enriquecidas em genes que codificam transportadores transmembranares ativos secundários. Nossa hipótese é que a hibridização em linhagens selvagens tropicais pode ter facilitado a transição de habitat que acompanha a colonização do ecossistema tropical.
Subject: Microorganismos - Aspectos geneticos
Ecologia molecular
Leveduras (Fungos)
Genômica
language: eng
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: Universidade Federal de Minas Gerais
Publisher Initials: UFMG
metadata.dc.publisher.department: ICB - DEPARTAMENTO DE BOTÂNICA
ICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA
Rights: Acesso Aberto
metadata.dc.identifier.doi: https://doi.org/10.1093%2Fgbe%2Fevv263
URI: http://hdl.handle.net/1843/72424
Issue Date: 2016
metadata.dc.url.externa: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4779607/#:~:text=Unexpectedly%2C%20the%20Brazilian%20population%20shows,encoding%20secondary%20active%20transmembrane%20transporters.
metadata.dc.relation.ispartof: Genome Biology and Evolution
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