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http://hdl.handle.net/1843/73328| Tipo: | Artigo de Periódico |
| Título: | Characterization of satellite DNAs in squirrel monkeys genus Saimiri (Cebidae, Platyrrhini) |
| Autor(es): | Mirela Pelizaro Valeri Guilherme Borges Dias Camila Nascimento Moreira Yatiyo Yonenaga-Yassuda Roscoe Stanyon Gustavo Campos e Silva Kuhn Marta Svartman |
| Resumen: | The genus Saimiri is a decades-long taxonomic and phylogenetic puzzle to which cytogenetics has contributed crucial data. All Saimiri species apparently have a diploid number of 2n = 44 but vary in the number of chromosome arms. Repetitive sequences such as satellite DNAs are potentially informative cytogenetic markers because they display high evolutionary rates. Our goal is to increase the pertinent karyological data by more fully characterizing satellite DNA sequences in the Saimiri genus. We were able to identify two abundant satellite DNAs, alpha (~340 bp) and CapA (~1,500 bp), from short-read clustering of sequencing datasets from S. boliviensis. The alpha sequences comprise about 1% and the CapA 2.2% of the S. boliviensis genome. We also mapped both satellite DNAs in S. boliviensis, S. sciureus, S. vanzolinii, and S. ustus. The alpha has high interspecific repeat homogeneity and was mapped to the centromeres of all analyzed species. CapA is associated with non-pericentromeric heterochromatin and its distribution varies among Saimiri species. We conclude that CapA genomic distribution and its pervasiveness across Platyrrhini makes it an attractive cytogenetic marker for Saimiri and other New World monkeys. |
| Abstract: | O gênero Saimiri é um quebra-cabeça taxonômico e filogenético de décadas para o qual a citogenética contribuiu com dados cruciais. Todas as espécies de Saimiri aparentemente têm um número diplóide de 2n = 44, mas variam no número de braços cromossômicos. Sequências repetitivas, como DNAs satélites, são marcadores citogenéticos potencialmente informativos porque apresentam altas taxas evolutivas. Nosso objetivo é aumentar os dados cariológicos pertinentes, caracterizando de forma mais completa as sequências de DNA satélite no gênero Saimiri. Conseguimos identificar dois DNAs satélites abundantes, alfa (~340 bp) e CapA (~1.500 pb), a partir de agrupamento de leitura curta de conjuntos de dados de sequenciamento de S. boliviensis. As sequências alfa compreendem cerca de 1% e a CapA 2,2% do genoma de S. boliviensis. Também mapeamos ambos os DNAs satélites em S. boliviensis, S. sciureus, S. vanzolinii e S. ustus. O alfa possui alta homogeneidade de repetição interespecífica e foi mapeado nos centrômeros de todas as espécies analisadas. CapA está associada à heterocromatina não pericentromérica e sua distribuição varia entre as espécies de Saimiri. Concluímos que a distribuição genômica do CapA e sua difusão em Platyrrhini o tornam um marcador citogenético atraente para Saimiri e outros macacos do Novo Mundo. |
| Asunto: | DNA satélite Saimiri Genética |
| Idioma: | eng |
| País: | Brasil |
| Editor: | Universidade Federal de Minas Gerais |
| Sigla da Institución: | UFMG |
| Departamento: | ICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS |
| Tipo de acceso: | Acesso Aberto |
| Identificador DOI: | https://doi.org/10.1038/s41598-020-64620-1 |
| URI: | http://hdl.handle.net/1843/73328 |
| Fecha del documento: | 2020 |
| metadata.dc.url.externa: | https://www.nature.com/articles/s41598-020-64620-1 |
| metadata.dc.relation.ispartof: | Scientific Reports |
| Aparece en las colecciones: | Artigo de Periódico |
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