Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1843/73340
Type: Artigo de Periódico
Title: Fungal and fungal‑like diversity in marine sediments from the maritime Antarctic assessed using DNA metabarcoding
Other Titles: Fúngicos e semelhantes a fungos diversidade em sedimentos marinhos da Antártica marítima avaliado usando DNA metabarcodificação
Authors: Mayanne Karla da Silva
Paulo E. A. S. Câmara
Luiz Henrique Rosa
Láuren Machado Drumond de Souza
Rosemary Vieira
Arthur Ayres Neto
Fabyano A. C. Lopes
Fábio S. de Oliveira
Peter Convey
Micheline Carvalho Silva
Alysson Wagner Fernandes Duarte
Abstract: We assessed the fungal and fungal-like sequence diversity present in marine sediments obtained in the vicinity of the South Shetland Islands (Southern Ocean) using DNA metabarcoding through high-throughput sequencing (HTS). A total of 193,436 DNA reads were detected in sediment obtained from three locations: Walker Bay (Livingston Island) at 52 m depth (48,112 reads), Whalers Bay (Deception Island) at 151 m (104,704) and English Strait at 404 m (40,620). The DNA sequence reads were assigned to 133 distinct fungal amplicon sequence variants (ASVs) representing the phyla Ascomycota, Basidiomycota, Mortierellomycota, Chytridiomycota, Glomeromycota, Monoblepharomycota, Mucoromycota and Rozellomycota and the fungal-like Straminopila. Thelebolus balaustiformis, Pseudogymnoascus sp., Fungi sp. 1, Ciliophora sp., Agaricomycetes sp. and Chaetoceros sp. were the dominant assigned taxa. Thirty-eight fungal ASVs could only be assigned to higher taxonomic levels, and may represent taxa not currently included in the available databases or represent new taxa and/or new records for Antarctica. The total fungal community displayed high indices of diversity, richness and moderate to low dominance. However, diversity and taxa distribution varied across the three sampling sites. In Walker Bay, unidentified fungi were dominant in the sequence assemblage. Whalers Bay sediment was dominated by Antarctic endemic and cold-adapted taxa. Sediment from English Strait was dominated by Ciliophora sp. and Chaetoceros sp. These fungal assemblages were dominated by saprotrophic, plant and animal pathogenic and symbiotic taxa. The detection of an apparently rich and diverse fungal community in these marine sediments reinforces the need for further studies to characterize their richness, functional ecology and potential biotechnological applications.
Abstract: Avaliamos a diversidade de sequências fúngicas e semelhantes a fungos presentes em sedimentos marinhos obtidos nas proximidades das Ilhas Shetland do Sul (Oceano Antártico) usando metabarcoding de DNA através de sequenciamento de alto rendimento (HTS). Um total de 193.436 leituras de DNA foram detectadas em sedimentos obtidos de três locais: Walker Bay (Ilha Livingston) a 52 m de profundidade (48.112 leituras), Whalers Bay (Ilha Deception) a 151 m (104.704) e Estreito Inglês a 404 m (40.620). ). As leituras da sequência de DNA foram atribuídas a 133 variantes distintas da sequência de amplicon fúngico (ASVs) representando os filos Ascomycota, Basidiomycota, Mortierellomycota, Chytridiomycota, Glomeromycota, Monoblepharomycota, Mucoromycota e Rozellomycota e o Straminopila semelhante a um fungo. Thelebolus balaustiformis, Pseudogymnoascus sp., Fungi sp. 1, Ciliophora sp., Agaricomycetes sp. e Chaetoceros sp. foram os táxons atribuídos dominantes. Trinta e oito ASVs fúngicos só poderiam ser atribuídos a níveis taxonômicos mais elevados e podem representar táxons não incluídos atualmente nos bancos de dados disponíveis ou representar novos táxons e/ou novos registros para a Antártida. A comunidade fúngica total apresentou altos índices de diversidade, riqueza e dominância moderada a baixa. No entanto, a diversidade e a distribuição dos táxons variaram nos três locais de amostragem. Em Walker Bay, fungos não identificados foram dominantes na montagem da sequência. Os sedimentos da Baía dos Baleeiros foram dominados por táxons endêmicos da Antártida e adaptados ao frio. O sedimento do Estreito Inglês foi dominado por Ciliophora sp. e Chaetoceros sp. Essas assembleias fúngicas foram dominadas por táxons saprotróficos, patogênicos de plantas e animais e simbióticos. A detecção de uma comunidade fúngica aparentemente rica e diversificada nestes sedimentos marinhos reforça a necessidade de mais estudos para caracterizar a sua riqueza, ecologia funcional e potenciais aplicações biotecnológicas.
Subject: Fungos
Ecologia
Biologia Marinha
language: eng
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: Universidade Federal de Minas Gerais
Publisher Initials: UFMG
metadata.dc.publisher.department: ICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA
Rights: Acesso Aberto
metadata.dc.identifier.doi: https://doi.org/10.1038/s41598-022-25310-2
URI: http://hdl.handle.net/1843/73340
Issue Date: 2022
metadata.dc.url.externa: https://www.nature.com/articles/s41598-022-25310-2
metadata.dc.relation.ispartof: Scientific Reports
Appears in Collections:Artigo de Periódico

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Fungal and fungal‑like.pdfA.pdf909.38 kBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.