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http://hdl.handle.net/1843/73412
Tipo: | Artigo de Periódico |
Título: | Identification and characterization of satellite DNAs in two-toed sloths of the genus Choloepus (Megalonychidae, Xenarthra) |
Autor(es): | Radarane Santos Sena Pedro Heringer Mirela Pelizaro Valeri Valéria Socorro Pereira Gustavo Campos e Silva Kuhn Marta Svartman |
Resumen: | Choloepus, the only extant genus of the Megalonychidae family, is composed of two living species of two-toed sloths: Choloepus didactylus and C. hoffmanni. In this work, we identified and characterized the main satellite DNAs (satDNAs) in the sequenced genomes of these two species. SATCHO1, the most abundant satDNA in both species, is composed of 117 bp tandem repeat sequences. The second most abundant satDNA, SATCHO2, is composed of ~ 2292 bp tandem repeats. Fluorescence in situ hybridization in C. hoffmanni revealed that both satDNAs are located in the centromeric regions of all chromosomes, except the X. In fact, these satDNAs present some centromeric characteristics in their sequences, such as dyad symmetries predicted to form secondary structures. PCR experiments indicated the presence of SATCHO1 sequences in two other Xenarthra species: the tree-toed sloth Bradypus variegatus and the anteater Myrmecophaga tridactyla. Nevertheless, SATCHO1 is present as large tandem arrays only in Choloepus species, thus likely representing a satDNA exclusively in this genus. Our results reveal interesting features of the satDNA landscape in Choloepus species with the potential to aid future phylogenetic studies in Xenarthra and mammalian genomes in general. |
Abstract: | Choloepus, o único gênero existente da família Megalonychidae, é composto por duas espécies vivas de preguiças de dois dedos: Choloepus didactylus e C. hoffmanni. Neste trabalho identificamos e caracterizamos os principais DNAs satélites (satDNAs) nos genomas sequenciados destas duas espécies. SATCHO1, o satDNA mais abundante em ambas as espécies, é composto por sequências repetidas em tandem de 117 pb. O segundo satDNA mais abundante, SATCHO2, é composto por repetições em tandem de ~ 2292 pb. A hibridização fluorescente in situ em C. hoffmanni revelou que ambos os satDNAs estão localizados nas regiões centroméricas de todos os cromossomos, exceto o X. Na verdade, esses satDNAs apresentam algumas características centroméricas em suas sequências, como simetrias de díade previstas para formar estruturas secundárias. Experimentos de PCR indicaram a presença de sequências SATCHO1 em outras duas espécies de Xenarthra: a preguiça Bradypus variegatus e o tamanduá Myrmecophaga tridactyla. No entanto, SATCHO1 está presente como grandes arranjos em tandem apenas nas espécies de Choloepus, provavelmente representando um satDNA exclusivamente neste gênero. Nossos resultados revelam características interessantes da paisagem satDNA em espécies de Choloepus com potencial para auxiliar futuros estudos filogenéticos em Xenarthra e genomas de mamíferos em geral. |
Asunto: | DNA satélite Preguiça (Zoologia) Genética |
Idioma: | eng |
País: | Brasil |
Editor: | Universidade Federal de Minas Gerais |
Sigla da Institución: | UFMG |
Departamento: | ICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS |
Tipo de acceso: | Acesso Aberto |
Identificador DOI: | https://doi.org/10.1038/s41598-020-76199-8 |
URI: | http://hdl.handle.net/1843/73412 |
Fecha del documento: | 2020 |
metadata.dc.url.externa: | https://www.nature.com/articles/s41598-020-76199-8 |
metadata.dc.relation.ispartof: | Scientifc Reports |
Aparece en las colecciones: | Artigo de Periódico |
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