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Type: Dissertação de Mestrado
Title: Teoria do coalescente e Computação Bayesiana aproximada como ferramentas para resolver questões da genética de populaçõeslatino-americanas
Authors: Mateus Henrique Gouveia
First Advisor: Eduardo Martin Tarazona Santos
First Co-advisor: Marília de Oliveira Scliar
Abstract: No presente trabalho utilizamos a teoria do coalescente e uma nova metodologia estatística conhecida como Aproximação Bayesiana Computacional (Approximate Bayesian Computation - ABC) para simular dados genéticos e inferir parâmetros demográficos associados à história de populações Latino-Americanas. Utilizamos 10 regiôes neutras previamente selecionadas por Frisse, 2001 especificamente para estudar história demográfica humana. Trabalhamos com o modelo genético-demográfico previamente estudado pela Dra. Marília Scliar de divergência populacional seguida de fluxo gênico entre populações nativas peruanas dos Andes (Quechuas) e da Selva Alta Amazônica (Shimaas), no qual inserimos o parâmetro recombinação e uma nova estatística informativa do tempo de divergência. Também utilizamos as populações Quechuas e Shimaas para estudar um modelo mais complexo de povoamento da América por populações Siberianas e divergência entre populações Nativo-Americanas. Além disso, simulamos dados genéticos de populações com uma história demográfica compatível com a formação das populações miscigendas Latino-Americanas, que nos permitirá testar hipóteses genético-populacionais no âmbito do projeto Epigen. Para os dois modelos demográficos estudados encontramos um tempo de divergência menor que 5.000 anos entre as populações Quechuas e Shimaas, o que sugere que a separação entre essas populações ocorreu após a colonização do continente americano. Com o modelo de povoamento da América estimamos o tempo de entrada na América mais provável em torno de 22 mil anos e um número efetivo fundador em torno de 400 indivíduos.
Abstract: In this study we used the coalescent theory and a new statistical methodology known as Approximate Bayesian Computation - ABC to simulate genetic data and to infer demographic parameters associated with the history of Latin American populations. We used ten neutralregions previously selected by Frisse, 2001 specifically to study human demographic history. We used the population-genetic model previously studied by Dr. Marilia Scliar of population divergence followed by gene flow between two populations of native Peruvian Andes (Quechuas) and Selva Alta Amazon (Shimaas), in which we added a recombinationparameter and a new informative statistic to study the divergence time among populations. We also used the Quechuas and Shimaas to study a more complex model of American peopling by Siberian populations and divergence between Native American populations. Furthermore, we simulated genetic data from populations with a demographic history compatible with the formation of Latin American admixed populations, which will allow us testing genetic hypotheses in the context of Epigen project. In the two demographic models proposed we found a divergence time less than 5000 years between the Quechua and Shimaa populations, what suggests that the separation between these populations occurred after the colonization of America. Finally, we estimated most likely time of American peopling of around 22,000 years and a founder effective number about 400 individuals.
Subject: Genética
Teoria bayesiana de decisão estatistica
Genética de populações
language: Português
Publisher: Universidade Federal de Minas Gerais
Publisher Initials: UFMG
Rights: Acesso Aberto
URI: http://hdl.handle.net/1843/BUOS-96CJP4
Issue Date: 17-Jan-2013
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