Draft genome sequence of Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T, a xylan-degrading yeast species isolated from rotting wood samples in Brazil
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Universidade Federal de Minas Gerais
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Resumo
We present the draft genome sequence of the type strain of the yeast Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T), a xylan-degrading species capable of fermenting d-xylose to ethanol. The assembled genome has a size of ~ 13.7 Mb and a GC content of 33.8% and contains 5971 protein-coding genes. We identified 15 genes with significant similarity to the d-xylose reductase gene from several other fungal species. The draft genome assembled from whole-genome shotgun sequencing of the yeast Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T) has been deposited at DDBJ/ENA/GenBank under the accession number MQSX00000000 under version MQSX01000000.
Abstract
Apresentamos o rascunho da sequência do genoma da cepa da levedura Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T), uma espécie degradadora de xilana capaz de fermentar d-xilose em etanol. O genoma montado tem um tamanho de ~ 13,7 Mb e um conteúdo de GC de 33,8% e contém 5.971 genes codificadores de proteínas. Identificamos 15 genes com similaridade significativa com o gene da d-xilose redutase de várias outras espécies de fungos. O rascunho do genoma montado a partir do sequenciamento shotgun de todo o genoma da levedura Sugiyamaella xylanicola UFMG-CM-Y1884T (= UFMG-CA-32.1T = CBS 12683T) foi depositado em DDBJ/ENA/GenBank sob o número de acesso MQSX00000000 na versão MQSX01000000.
Assunto
Genoma microbiano, D-xilose, Leveduras (Fungos)
Palavras-chave
Sugiyamaella xylanicola, Genome sequence, D-xylose-fermenting yeast, Xylan-degrading species
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Endereço externo
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213596017300156