Recent advances in point of care testing for COVID-19 detection

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Resumo

The World Health Organizations declaration of the COVID-19 pandemic was a milestone for the scientific community. The high transmission rate and the huge number of deaths, along with the lack of knowledge about the virus and the evolution of the disease, stimulated a relentless search for diagnostic tests, treatments, and vaccines. The main challenges were the differential diagnosis of COVID-19 and the development of specific, rapid, and sensitive tests that could reach all people. RT-PCR remains the gold standard for diagnosing COVID-19. However, new methods, such as other molecular techniques and immunoassays emerged. Also, the need for accessible tests with quick results boosted the development of point of care tests (POCT) that are fast, and automated, with high precision and accuracy. This assay reduces the dependence on laboratory conditions and mass testing of the population, dispersing the pressure regarding screening and detection. This review summarizes the advances in the diagnostic field since the pandemic started, emphasizing various laboratory techniques for detecting COVID-19. We reviewed the main existing diagnostic methods, as well as POCT under development, starting with RT-PCR detection, but also exploring other nucleic acid techniques, such as digital PCR, loop-mediated isothermal amplification-based assay (RT-LAMP), clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR), and next-generation sequencing (NGS), and immunoassay tests, and nanoparticle-based biosensors, developed as portable instruments for the rapid standard diagnosis of COVID-19.

Abstract

A declaração da Organização Mundial da Saúde sobre a pandemia da COVID-19 foi um marco para a comunidade científica. A alta taxa de transmissão e o grande número de mortes, juntamente com a falta de conhecimento sobre o vírus e a evolução da doença, estimularam uma busca incessante por testes diagnósticos, tratamentos e vacinas. Os principais desafios foram o diagnóstico diferencial da COVID-19 e o desenvolvimento de testes específicos, rápidos e sensíveis que pudessem atingir todas as pessoas. O RT-PCR continua sendo o padrão ouro para o diagnóstico da COVID-19. No entanto, novos métodos, como outras técnicas moleculares e imunoensaios, surgiram. Além disso, a necessidade de testes acessíveis com resultados rápidos impulsionou o desenvolvimento de testes de ponto de atendimento (POCT) que são rápidos e automatizados, com alta precisão e exatidão. Este ensaio reduz a dependência de condições laboratoriais e testes em massa da população, dispersando a pressão sobre triagem e detecção. Esta revisão resume os avanços no campo do diagnóstico desde o início da pandemia, enfatizando várias técnicas laboratoriais para detecção da COVID-19. Revisamos os principais métodos diagnósticos existentes, bem como o POCT em desenvolvimento, começando com a detecção por RT-PCR, mas também explorando outras técnicas de ácido nucleico, como PCR digital, ensaio baseado em amplificação isotérmica mediada por loop (RT-LAMP), repetições palindrômicas curtas regularmente interespaçadas agrupadas (CRISPR) e sequenciamento de última geração (NGS), e testes de imunoensaio e biossensores baseados em nanopartículas, desenvolvidos como instrumentos portáteis para o diagnóstico rápido padrão da COVID-19.

Assunto

SARS-CoV-2, COVID-19, Diagnóstico, Testes imediatos, Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa, Repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente espaçadas, Imunoensaio

Palavras-chave

SARS-CoV-2, COVID-19, Diagnosis, Point-of-care testing, RT-PCR, Nanobiosensors, RT-LAMP, CRISPR, Immunoassay

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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0753332222009271?via%3Dihub

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