Characterization of a new multidrug-resistant brazilian K. pneumoniae isolate and 172 Klebsiella spp. sequenced strains: genomic island, multilocus sequence typing and capsule locus dataset

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dc.creatorRodrigo Profeta Silveira Santos
dc.creatorNúbia Seyffert
dc.creatorSandeep Tiwari
dc.creatorMarcus Vinicius Canário Viana
dc.creatorArun Kumar Jaiswal
dc.creatorAna Carolina Barbosa Caetano
dc.creatorDaniel Henrique Bücker
dc.creatorLuciana Tavares de Oliveira
dc.creatorRoselane Gonçalves dos Santos
dc.creatorAlfonso Gala García
dc.creatorRodrigo Bentes Kato
dc.creatorFrancine Ferreira Padilha
dc.creatorIsabel Bezerra Lima-Verde
dc.creatorPreetam Ghosh
dc.creatorDebmalya Barh
dc.creatorAristóteles Góes Neto
dc.creatorHenrique Cesar Pereira Figueiredo
dc.creatorSiomar de Castro Soares
dc.creatorRoberto José Meyer Nascimento
dc.creatorBertram Brenig
dc.creatorPablo Ivan Pereira Ramos
dc.creatorVasco Ariston de Carvalho Azevedo
dc.creatorThiago Luiz de Paula Castro
dc.date.accessioned2023-05-19T19:52:55Z
dc.date.accessioned2025-09-09T00:52:10Z
dc.date.available2023-05-19T19:52:55Z
dc.date.issued2021-02
dc.description.abstractO gênero Klebsiella compreende espécies que causam infecções nosocomiais e adquiridas na comunidade. Um conjunto de dados foi criado para compilar as informações do tipo de sequência (ST) e do tipo de cápsula (K-locus) previstas para 172 isolados mundiais de Klebsiella spp. cujos genomas completos podem ser recuperados do repositório GenBank (NCBI). O conjunto de dados também inclui informações relacionadas a uma cepa multirresistente (B31) isolada de um paciente internado em uma unidade de terapia intensiva na região Nordeste do Brasil. Esta cepa foi caracterizada fenotipicamente e submetida a sequenciamento de todo o genoma e análise genômica comparativa, como relatamos recentemente [1]. O conjunto de dados também compila informações sobre Ilhas de Patogenicidade (PIs), Ilhas de Resistência (RIs) e Ilhas Diversas (MIS) presentes no genoma da cepa B31. As informações fornecidas aqui podem apoiar políticas de prevenção de surtos e futuros estudos epidemiológicos envolvendo Klebsiella spp.
dc.description.sponsorshipCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
dc.description.sponsorshipFAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais
dc.description.sponsorshipCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
dc.format.mimetypepdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1016/j.dib.2021.106746
dc.identifier.issn2352-3409
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/1843/53667
dc.languageeng
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.relation.ispartofData in Brief
dc.rightsAcesso Aberto
dc.subjectIlhas genômicas
dc.subjectTipagem de sequências multilocus
dc.subjectKlebsiella pneumoniae
dc.subjectResistência microbiana a medicamentos
dc.subjectVirulência
dc.subject.otherGenomic island
dc.subject.otherMultilocus sequence typing
dc.subject.otherCapsular typing
dc.subject.otherKlebsiella pneumoniae
dc.subject.otherAntibiotic resistance
dc.subject.otherBacterial virulence
dc.titleCharacterization of a new multidrug-resistant brazilian K. pneumoniae isolate and 172 Klebsiella spp. sequenced strains: genomic island, multilocus sequence typing and capsule locus dataset
dc.title.alternativeCaracterização de um novo isolado brasileiro multirresistente de K. pneumoniae e 172 Klebsiella spp. cepas sequenciadas: ilha genômica, tipagem de sequência multilocus e conjunto de dados do locus da cápsula
dc.typeArtigo de periódico
local.citation.volume34
local.description.resumoThe genus Klebsiella comprises species that cause nosocomial and community-acquired infections. A dataset was created to compile the sequence type (ST) and capsule type (K-locus) information predicted for 172 worldwide isolates of Klebsiella spp. whose complete genomes could be retrieved from the GenBank (NCBI) repository. The dataset also includes information related to one multidrug-resistant strain (B31) isolated from a patient who was admitted to an intensive care unit in the Northeast region of Brazil. This strain was phenotypically characterized and submitted to wholegenome sequencing and comparative genomics analysis as we recently reported [1]. The dataset also compiles information on Pathogenicity Islands (PIs), Resistance Islands (RIs) and Miscellaneous Islands (MIS) present in the genome of strain B31. The information provided here may support outbreak prevention policies and future epidemiological studies involving Klebsiella spp.
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-0487-3058
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-2193-6508
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-8554-1660
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-7017-6437
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-0558-483X
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-5253-4261
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-1454-7678
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-7821-1471
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-3934-1094
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-9046-1702
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-5892-4252
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-2557-7768
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-7692-6243
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-1022-6842
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-7299-3724
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-4727-4805
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-7635-9656
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-9075-7861
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-4775-2280
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-2869-5065
local.publisher.countryBrasil
local.publisher.departmentHCL - HOSPITAL DAS CLINICAS
local.publisher.departmentICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA
local.publisher.departmentICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS
local.publisher.departmentVET - DEPARTAMENTO DE MEDICINA VETERINÁRIA PREVENTIVA
local.publisher.initialsUFMG
local.url.externahttps://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340921000329?via%3Dihub

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