Diversity, distribution and ecology of fungal communities present in Antarctic lake sediments uncovered by DNA metabarcoding

dc.creatorLáuren Machado Drumond de Souza
dc.creatorJuan Manuel Lirio
dc.creatorSilvia Herminda Coria
dc.creatorFabyano Alvares Cardoso Lopes
dc.creatorPeter Convey
dc.creatorMicheline Carvalho-Silva
dc.creatorFábio Soares de Oliveira
dc.creatorCarlos Augusto Rosa
dc.creatorPaulo Eduardo Aguiar Saraiva Câmara
dc.creatorLuiz Henrique Rosa
dc.date.accessioned2023-10-23T21:14:29Z
dc.date.accessioned2025-09-09T00:13:29Z
dc.date.available2023-10-23T21:14:29Z
dc.date.issued2022
dc.description.abstractAvaliamos a diversidade fúngica em sedimentos obtidos de quatro lagos nas Ilhas Shetland do Sul e na Ilha James Ross, na Antártica, usando metabarcoding de DNA. Detectamos 218 variantes de sequências de amplicon (ASVs) dominadas pelos filos Ascomycota, Basidiomycota, Mortierellomycota, Mucoromycota e Chytridiomycota. Além disso, foram detectados os raros filos Aphelidiomycota, Basidiobolomycota, Blastocladiomycota, Monoblepharomycota, Rozellomycota e Zoopagomycota, bem como Straminopila semelhante a fungos pertencentes aos filos Bacillariophyta e Oomycota. As assembleias fúngicas foram dominadas por táxons fúngicos desconhecidos (Fungal sp. 1 e Fungal sp. 2), seguidos por Talaromyces rubicundus e Dactylonectria anthuriicola. Em geral, apresentaram elevada diversidade, riqueza e dominância moderada. Foram detectadas sequências representando fungos saprófitos, patogênicos e simbióticos, incluindo o fungo fitopatogênico D. anthuriicola que era abundante no relativamente jovem Lago Soto na Ilha Deception. Os sedimentos lacustres estudados continham o DNA de comunidades fúngicas ricas, diversas e complexas, incluindo fungos comumente relatados na Antártica e outros táxons considerados raros. No entanto, como o estudo foi baseado no uso de DNA ambiental, que não confirma inequivocamente a presença de organismos ativos ou viáveis, são necessários mais estudos utilizando outras abordagens, como o sequenciamento shotgun, para elucidar a ecologia dos fungos nesses sedimentos lacustres antárticos.
dc.description.sponsorshipCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
dc.description.sponsorshipFAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais
dc.description.sponsorshipCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
dc.description.sponsorshipINCT – Instituto nacional de ciência e tecnologia (Antigo Instituto do Milênio)
dc.format.mimetypepdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1038/s41598-022-12290-6
dc.identifier.issn2045-2322
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/1843/59869
dc.languageeng
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.relation.ispartofScientific Reports
dc.rightsAcesso Aberto
dc.subjectMicobioma
dc.subjectEcologia - Antártica
dc.subjectBarcode de DNA
dc.subject.otherFungal communities
dc.subject.otherAntarctic
dc.subject.otherDNA metabarcoding
dc.titleDiversity, distribution and ecology of fungal communities present in Antarctic lake sediments uncovered by DNA metabarcoding
dc.title.alternativeDiversidade, distribuição e ecologia de comunidades fúngicas presentes em sedimentos de lagos antárticos descobertos por metabarcodificação de DNA
dc.typeArtigo de periódico
local.citation.volume12
local.description.resumoWe assessed fungal diversity in sediments obtained from four lakes in the South Shetland Islands and James Ross Island, Antarctica, using DNA metabarcoding. We detected 218 amplicon sequence variants (ASVs) dominated by the phyla Ascomycota, Basidiomycota, Mortierellomycota, Mucoromycota and Chytridiomycota. In addition, the rare phyla Aphelidiomycota, Basidiobolomycota, Blastocladiomycota, Monoblepharomycota, Rozellomycota and Zoopagomycota as well as fungal-like Straminopila belonging to the phyla Bacillariophyta and Oomycota were detected. The fungal assemblages were dominated by unknown fungal taxa (Fungal sp. 1 and Fungal sp. 2), followed by Talaromyces rubicundus and Dactylonectria anthuriicola. In general, they displayed high diversity, richness and moderate dominance. Sequences representing saprophytic, pathogenic and symbiotic fungi were detected, including the phytopathogenic fungus D. anthuriicola that was abundant, in the relatively young Soto Lake on Deception Island. The lake sediments studied contained the DNA of rich, diverse and complex fungal communities, including both fungi commonly reported in Antarctica and other taxa considered to be rare. However, as the study was based on the use of environmental DNA, which does not unequivocally confirm the presence of active or viable organisms, further studies using other approaches such as shotgun sequencing are required to elucidate the ecology of fungi in these Antarctic lake sediments.
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-1019-8407
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-4565-9103
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-8497-9903
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-2389-3804
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-1450-7609
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-9749-5182
local.publisher.countryBrasil
local.publisher.departmentICB - DEPARTAMENTO DE BOTÂNICA
local.publisher.departmentICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA
local.publisher.departmentIGC - DEPARTAMENTO DE GEOGRAFIA
local.publisher.initialsUFMG
local.url.externahttps://www.nature.com/articles/s41598-022-12290-6

Arquivos

Pacote original

Agora exibindo 1 - 1 de 1
Carregando...
Imagem de Miniatura
Nome:
Diversity, distribution and ecology of fungal communities present in Antarctic lake sediments uncovered by DNA metabarcoding.pdf
Tamanho:
601.67 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format

Licença do pacote

Agora exibindo 1 - 1 de 1
Carregando...
Imagem de Miniatura
Nome:
License.txt
Tamanho:
1.99 KB
Formato:
Plain Text
Descrição: