First description of a satellite DNA in manatees’ centromeric regions

Abstract

Trichechus manatus e Trichechus inunguis são as duas espécies de Sirenia que ocorrem nas Américas. Apesar do seu crescente risco de extinção, muitos aspectos da sua biologia permanecem pouco estudados, incluindo a fracção repetitiva de DNA dos seus genomas. Aqui utilizamos o genoma sequenciado de T. manatus e TAREAN para identificar DNAs satélites (satDNAs) nesta espécie. Relatamos a primeira descrição do TMAsat, um satDNA compreendendo ~0,87% do genoma, com monômeros de ~684pb e localização centromérica. Em T. inunguis, o TMAsat mostrou comprimento de monômero semelhante, localização cromossômica e motivos conservados em forma de caixa CENP-B como em T. manatus. Também detectamos este satDNA no Dugon dugong e nos agora extintos genomas de Hydrodamalis gigas. A árvore de junção de vizinhos mostra que as sequências TMAsat de T. manatus, T. inunguis, D. dugon e H. gigas carecem de agrupamentos específicos de espécies, o que discorda das previsões de evolução concertada. Detectamos uma sequência homóloga divergente do tipo TMAsat em elefantes e hyraxes, mas não em outros mamíferos, sugerindo que esta sequência já estava presente no ancestral comum de Paenungulata, e mais tarde se tornou um satDNA nos Sirenianos. Esta é a primeira descrição de um satDNA centromérico em peixes-boi e facilitará a inclusão de Sirenia em estudos futuros de centrômeros e biologia do satDNA.