Uma abordagem de Medicina de Redes revela mecanismos moleculares e novas drogas candidatas para doenças neuropsiquiátricas, infecciosas e inflamatórias crônicas
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Universidade Federal de Minas Gerais
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Tese de doutorado
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Primeiro orientador
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Roney Coimbra
Niels Olsen Saraiva Câmara
Antônio Carlos Pinheiro
Rafael Pinto Vieira
Niels Olsen Saraiva Câmara
Antônio Carlos Pinheiro
Rafael Pinto Vieira
Resumo
Milhões de artigos científicos estão disponíveis em plataformas online, e a cada dia
milhares de novos trabalhos são publicados. Ler todos esses trabalhos é humanamente
impossível para pesquisadores individualmente. Algoritmos de mineração de texto
associados à computação cognitiva, como o IBM Watson for Drug Discovery , são
capazes de ler toda a literatura biomédica e produzir redes de conhecimento contendo
conexões entre termos como genes, doenças e drogas. A Medicina de Redes utiliza
redes complexas para compreender como as doenças se relacionam por meio dos
genes associados a elas. Milhares de artigos sobre as bases moleculares de doenças
neuropsiquiátricas e inflamatórias crônicas existem na literatura. No entanto, ainda há
aspectos pouco compreendidos e muitas das drogas existentes são pouco eficazes.
Neste trabalho, redes de conhecimento sobre genes, doenças e drogas obtidas pelo
Watson for Drug Discovery foram analisadas por uma abordagem de Medicina de
Redes para (1) avaliar a evolução do conhecimento sobre doenças neuropsiquiátricas,
inflamatórias e infecciosas nos últimos 30 anos, (2) compreender os principais
mecanismos moleculares de doenças neuropsiquiátricas e inflamatórias crônicas e (3)
encontrar drogas com potencial de reposicionamento para uso em doenças
neuropsiquiátricas e inflamatórias crônicas.
Abstract
Millions of scientific articles are available on online platforms, and thousands of new
papers are published every day. Reading all these studies is humanly impossible for the
individual researcher. Text mining algorithms associated with cognitive computing such
as IBM Watson for Drug Discovery are able to read through the biomedical literature
and produce knowledge networks containing known connections between terms such
as genes, diseases and drugs. Network Medicine uses complex networks to understand
how diseases are related through the genes they share. Neuropsychiatric and chronic
inflammatory diseases are widely studied and thousands of articles on the molecular
basis of these diseases exist in the literature. However, there are still many aspects of
these disorders that are not fully understood, and existing drug treatments are often
ineffective. Here, knowledge networks of genes, diseases and drugs obtained with
Watson for Drug Discovery were analyzed using a Network Medicine framework to (1)
evaluate the evolution of knowledge of genes and biological processes related to
neuropsychiatric, inflammatory and infectious diseases in the last 30 years, (2)
understand the main molecular mechanisms of neuropsychiatric and chronic
inflammatory diseases and (3) find drugs already used for other diseases that have the
potential to be repositioned for use in neuropsychiatric and chronic inflammatory
diseases.
Assunto
Bioquímica e imunologia, Software de aplicação, Informática médica, Mineração de textos, Neuropsiquiatria, Inflamação, Reposicionamento de medicamentos
Palavras-chave
mineração de texto, Watson for Drug Discovery, Medicina de Redes, doenças neuropsiquiátricas, doenças inflamatórias crônicas, reposicionamento de drogas
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