Evidence of Natural Hybridization in Brazilian Wild Lineages of Saccharomyces cerevisiae

dc.creatorRaquel Barbosa
dc.creatorCarlos Augusto Rosa
dc.creatorJosé Paulo Sampaio
dc.creatorPedro Almeida
dc.creatorSilvana V. B. Safar
dc.creatorRenata Oliveira Santos
dc.creatorPaula B. Morais
dc.creatorLou Nielly-Thibault
dc.creatorJean-Baptiste Leducq
dc.creatorChristian R. Landry
dc.creatorPaula Gonçalves
dc.date.accessioned2024-08-02T19:21:07Z
dc.date.accessioned2025-09-08T23:35:39Z
dc.date.available2024-08-02T19:21:07Z
dc.date.issued2016
dc.description.abstractA biologia natural de Saccharomyces cerevisiae, o modelo eucariota unicelular mais conhecido, permanece pouco documentada e compreendida, embora progressos recentes tenham começado a mudar esta situação. Estudos realizados recentemente no Hemisfério Norte revelaram a existência de populações selvagens associadas aos carvalhos na América do Norte, na Ásia e na região do Mediterrâneo. No entanto, apesar destes avanços, a distribuição global das populações naturais de S. cerevisiae, especialmente em regiões onde os carvalhos e outros membros das Fagaceae estão ausentes, não é bem compreendida. Aqui investigamos a ocorrência de S. cerevisiae no Brasil, uma região tropical onde carvalhos e outras Fagaceae estão ausentes. Relatamos um candidato a habitat natural de S. cerevisiae na América do Sul e, usando dados do genoma completo, descobrimos novas linhagens que parecem ter como parentes mais próximos as populações selvagens encontradas na América do Norte e no Japão. Uma análise da estrutura populacional revelou a penetração do genótipo do vinho na população selvagem brasileira, uma primeira observação do impacto das linhagens de micróbios domesticados na estrutura genética das populações selvagens. Inesperadamente, a população brasileira apresenta evidências de hibridização com uma população americana de Saccharomyces paradoxus. As introgressões de S. paradoxus foram significativamente enriquecidas em genes que codificam transportadores transmembranares ativos secundários. Nossa hipótese é que a hibridização em linhagens selvagens tropicais pode ter facilitado a transição de habitat que acompanha a colonização do ecossistema tropical.
dc.description.sponsorshipOutra Agência
dc.format.mimetypepdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1093%2Fgbe%2Fevv263
dc.identifier.issn1759-6653
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/1843/72424
dc.languageeng
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.relation.ispartofGenome Biology and Evolution
dc.rightsAcesso Aberto
dc.subjectMicroorganismos - Aspectos geneticos
dc.subjectEcologia molecular
dc.subjectLeveduras (Fungos)
dc.subjectGenômica
dc.subject.otherMicrobe population genomics
dc.subject.otherYeast molecular ecology
dc.subject.otherIntrogression
dc.subject.otherGenome evolution
dc.subject.otherSaccharomyces paradoxus
dc.titleEvidence of Natural Hybridization in Brazilian Wild Lineages of Saccharomyces cerevisiae
dc.typeArtigo de periódico
local.citation.epage329
local.citation.issue2
local.citation.spage317
local.citation.volume8
local.description.resumoThe natural biology of Saccharomyces cerevisiae, the best known unicellular model eukaryote, remains poorly documented and understood although recent progress has started to change this situation. Studies carried out recently in the Northern Hemisphere revealed the existence of wild populations associated with oak trees in North America, Asia, and in the Mediterranean region. However, in spite of these advances, the global distribution of natural populations of S. cerevisiae, especially in regions were oaks and other members of the Fagaceae are absent, is not well understood. Here we investigate the occurrence of S. cerevisiae in Brazil, a tropical region where oaks and other Fagaceae are absent. We report a candidate natural habitat of S. cerevisiae in South America and, using whole-genome data, we uncover new lineages that appear to have as closest relatives the wild populations found in North America and Japan. A population structure analysis revealed the penetration of the wine genotype into the wild Brazilian population, a first observation of the impact of domesticated microbe lineages on the genetic structure of wild populations. Unexpectedly, the Brazilian population shows conspicuous evidence of hybridization with an American population of Saccharomyces paradoxus. Introgressions from S. paradoxus were significantly enriched in genes encoding secondary active transmembrane transporters. We hypothesize that hybridization in tropical wild lineages may have facilitated the habitat transition accompanying the colonization of the tropical ecosystem.
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-6790-8687
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-3236-651X
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-3028-6866
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-2103-1060
local.publisher.countryBrasil
local.publisher.departmentICB - DEPARTAMENTO DE BOTÂNICA
local.publisher.departmentICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA
local.publisher.initialsUFMG
local.url.externahttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4779607/#:~:text=Unexpectedly%2C%20the%20Brazilian%20population%20shows,encoding%20secondary%20active%20transmembrane%20transporters.

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