Detection of multiple human viruses, including Mpox, using a wastewater surveillance approach in Brazil

Abstract

A vigilância de esgoto pode ser usada como uma ferramenta complementar eficaz para detectar patógenos em comunidades locais, fornecendo insights sobre ameaças emergentes e auxiliando no monitoramento de surtos. Neste estudo usando qPCR e vigilância genômica completa de esgoto, detectamos o vírus Mpox juntamente com outros vírus, em águas residuais municipais e hospitalares em Belo Horizonte, Brasil, durante um período de 9 meses (de julho de 2022 a março de 2023). As taxas de detecção de DNA do MPXV variaram em nosso estudo, com 19,6% (11 de 56 amostras) detectadas através do método de captura híbrida de sequenciamento do genoma completo e 20% (12 de 60 amostras) através de qPCR. Em águas residuais hospitalares, a taxa de detecção foi maior, em 40% (12 de 30 amostras) em comparação com 13,3% (4 de 30 amostras) em águas residuais municipais. Essa variação pode ser atribuída ao número relativamente baixo de casos de MPXV relatados na cidade, que variou de 106 a 341 casos durante o período do estudo, e aos efeitos de diluição, dado que cada uma das duas estações de tratamento de águas residuais (ETAR) investigadas atende aproximadamente 1,1 milhão de habitantes. Além disso, outras nove famílias de vírus foram identificadas em hospitais e águas residuais municipais, incluindo Adenoviridae, Astroviridae, Caliciviridae, Picornaviridae, Polyomaviridae, Coronaviridae (que inclui SARS-CoV-2), Herspesviridae, Papillomaviridae e Flaviviridae (incluindo notavelmente Dengue). Essas descobertas ressaltam o potencial da vigilância genômica de esgoto como uma ferramenta robusta de saúde pública para monitorar uma ampla gama de vírus que circulam em ambientes comunitários e hospitalares, incluindo MPXV.