Retrospective detection and genetic characterization of porcine circovirus 3 (PCV3) strains identified between 2006 and 2007 in Brazil

Abstract

O circovírus suíno 3 (PCV3) é um vírus emergente que foi identificado pela primeira vez nos Estados Unidos em 2016. Desde a sua primeira detecção, o PCV3 já foi encontrado na América, Ásia e Europa. Embora o PCV3 já tenha sido descrito no Brasil, o conhecimento de sua detecção e variação de sequência antes de 2016 é limitado, bem como de sua distribuição nas principais regiões produtoras de suínos do Brasil. Neste estudo, 67 amostras clínicas suínas coletadas de nove estados do Brasil entre 2006 e 2007 foram analisadas para infecção por PCV3 por PCR. Os resultados mostraram que 47,8% das amostras foram positivas para PCV3, em todos os nove estados. Das amostras positivas para PCV3, 37,5% também foram positivas para PCV2. Curiosamente, não foram associados sinais clínicos a amostras que foram detectadas singularmente com infecção por PCV3. Além disso, a taxa positiva de PCV3 em porcos saudáveis foi superior (29,8%) à encontrada em porcos não saudáveis (17,9%), sugerindo que a maioria dos porcos poderia viver com infecção por PCV3 sem qualquer sinal clínico nas amostras analisadas. A análise da sequência de nucleotídeos mostrou que as estirpes de PCV3 obtidas neste estudo partilhavam 94,44% a 99,83% de identidade de sequência ao nível do gene do quadro de leitura aberto 2 (ORF2) com estirpes disponíveis de diferentes países. As sequências brasileiras de PCV3 coletadas em 2006 e 2007 compartilharam 97,94% a 99,62% de identidade com as cepas obtidas em 2016. Os resultados dos testes de neutralidade e pressão seletiva indicaram que a proteína Cap do PCV3 parece incapaz de tolerar altos níveis de variação em sua sequência. A análise filogenética agrupou as cepas brasileiras em grupos de genótipos de PCV3a e PCV3b, ambos incluindo cepas coletadas na América, Ásia e Europa. Considerando todos os resultados, vários eventos de introdução de PCV3 podem ter ocorrido no Brasil, e as cepas brasileiras de PCV3 podem apresentar estabilidade genética nos últimos 10 anos.