Species Distribution Modelling: Contrasting presence-only models with plot abundance data

dc.creatorVitor H. F. Gomes
dc.creatorDairon Cárdenas López
dc.creatorMarcos Silveira
dc.creatorMaria Cristina Peñuela Mora
dc.creatorPascal Petronelli
dc.creatorPaul Maas
dc.creatorRaquel Thomas Caesar
dc.creatorTerry W. Henkel
dc.creatorDoug Daly
dc.creatorMarcos Ríos Paredes
dc.creatorTim R. Baker
dc.creatorAlfredo Fuentes
dc.creatorJuan Ernesto Guevara
dc.creatorCarlos A. Peres
dc.creatorJerome Chave
dc.creatorJose Luis Marcelo Pena
dc.creatorKyle G. Dexter
dc.creatorMiles R. Silman
dc.creatorPeter Møller Jørgensen
dc.creatorToby Pennington
dc.creatorAnthony di Fiore
dc.creatorFernando Cornejo Valverde
dc.creatorJuan Fernando Phillips
dc.creatorWilliam E. Magnusson
dc.creatorGonzalo Rivas Torres
dc.creatorPatricio Von Hildebrand
dc.creatorTinde R. Van Andel
dc.creatorAdemir R. Ruschel
dc.creatorAdriana Prieto
dc.creatorAgustín Rudas
dc.creatorBruce Hoffman
dc.creatorCésar I. A. Vela
dc.creatorEdelcilio Marques Barbosa
dc.creatorEgleé L. Zent
dc.creatorOliver L. Phillips
dc.creatorGeorge Pepe Gallardo Gonzales
dc.creatorHilda Paulette Dávila Doza
dc.creatorIres Paula de Andrade Miranda
dc.creatorJean-louis Guillaumet
dc.creatorLinder Felipe Mozombite Pinto
dc.creatorLuiz Carlos de Matos Bonates
dc.creatorNatalino Silva
dc.creatorRicardo Zárate Gómez
dc.creatorStanford Zent
dc.creatorTherany Gonzales
dc.creatorFlorian Wittmann
dc.creatorVincent A. Vos
dc.creatorYadvinder Malhi
dc.creatorAlexandre A. Oliveira
dc.creatorAngela Cano
dc.creatorBianca Weiss Albuquerque
dc.creatorCorine Vriesendorp
dc.creatorDiego Felipe Correa
dc.creatorEmilio Vilanova Torre
dc.creatorGeertje Van Der Heijden
dc.creatorHirma Ramirez-angulo
dc.creatorMarcelo de Jesus Veiga Carim
dc.creatorJosé Ferreira Ramos
dc.creatorKenneth R. Young
dc.creatorMaira Rocha
dc.creatorMarcelo Trindade Nascimento
dc.creatorMaria Natalia Umaña Medina
dc.creatorMilton Tirado
dc.creatorOphelia Wang
dc.creatorRodrigo Sierra
dc.creatorArmando Torres-lezama
dc.creatorCasimiro Mendoza
dc.creatorMaria Pires Martins
dc.creatorCid Ferreira
dc.creatorCláudia Baider
dc.creatorDaniel Villarroel
dc.creatorHenrik Balslev
dc.creatorItalo Mesones
dc.creatorLigia Estela Urrego Giraldo
dc.creatorLuisa Fernanda Casas
dc.creatorManuel Augusto Ahuite Reategui
dc.creatorReynaldo Linares Palomino
dc.creatorRoderick Zagt
dc.creatorMariana Victória Irume
dc.creatorSasha Cárdenas
dc.creatorWilliam Farfan-rios
dc.creatorAdeilza Felipe Sampaio
dc.creatorDaniela Pauletto
dc.creatorElvis H. Valderrama Sandoval
dc.creatorFreddy Ramirez Arevalo
dc.creatorIsau Huamantupa Chuquimaco
dc.creatorKarina Garcia Cabrera
dc.creatorLionel Hernandez
dc.creatorLuis Valenzuela Gamarra
dc.creatorDaniel Sabatier
dc.creatorMiguel N. Alexiades
dc.creatorSusamar Pansini
dc.creatorWalter Palacios Cuenca
dc.creatorWilliam Milliken
dc.creatorJoana Ricardo
dc.creatorGabriela Lopez Gonzalez
dc.creatorEdwin Pos
dc.creatorHans Ter Steege
dc.creatorJean-françois Molino
dc.creatorStéphanie D. Ijff
dc.creatorOlaf S. Bánki
dc.creatorJosé Renan da Silva Guimarães
dc.creatorNigel C. A. Pitman
dc.creatorMaria Teresa Fernandez Piedade
dc.creatorAbel Monteagudo Mendoza
dc.creatorBruno Garcia Luize
dc.creatorEduardo Martins Venticinque
dc.creatorEvlyn Márcia Moraes de Leão Novo
dc.creatorPercy Núñez Vargas
dc.creatorThiago Sanna Freire Silva
dc.creatorNiels Raes
dc.creatorAngelo Gilberto Manzatto
dc.creatorJohn Terborgh
dc.creatorNeidiane Farias Costa Reis
dc.creatorJuan Carlos Montero
dc.creatorKatia Regina Casula
dc.creatorBeatriz S. Marimon
dc.creatorBen-hur Marimon
dc.creatorEuridice N. Honorio Coronado
dc.creatorTed R. Feldpausch
dc.creatorAlvaro Duque
dc.creatorIêda Leão Amaral
dc.creatorCharles Eugene Zartman
dc.creatorNicolás Castaño Arboleda
dc.creatorTimothy J. Killeen
dc.creatorBonifacio Mostacedo
dc.creatorRodolfo Vasquez
dc.creatorJochen Schöngart
dc.creatorRafael L. Assis
dc.creatorMarcelo Brilhante Medeiros
dc.creatorMarcelo Fragomeni Simon
dc.creatorAna Andrade
dc.creatorRafael P. Salomão
dc.creatorWilliam F. Laurance
dc.creatorJosé Luís Camargo
dc.creatorLayon O. Demarchi
dc.creatorSusan G. W. Laurance
dc.creatorEmanuelle de Sousa Farias
dc.creatorHenrique Eduardo Mendonça Nascimento
dc.creatorJuan David Cardenas Revilla
dc.creatorAdriano Quaresma
dc.creatorFlavia R. C. Costa
dc.creatorIma Célia Guimarães Vieira
dc.creatorLuiz de Souza Coelho
dc.creatorBruno Barçante Ladvocat Cintra
dc.creatorHernán Castellanos
dc.creatorRoel Brienen
dc.creatorPablo R. Stevenson
dc.creatorYuri Feitosa
dc.creatorJoost F. Duivenvoorden
dc.creatorGerardo A. Aymard C.
dc.creatorHugo F. Mogollón
dc.creatorNatalia Targhetta
dc.creatorJames A. Comiskey
dc.creatorFrancisca Dionízia de Almeida Matos
dc.creatorAlberto Vicentini
dc.creatorAline Lopes
dc.creatorGabriel Damasco
dc.creatorNállarett Dávila
dc.creatorRoosevelt García-villacorta
dc.creatorCarolina Levis
dc.creatorJuliana Schietti
dc.creatorPriscila Souza
dc.creatorThaise Emilio
dc.creatorAlfonso Alonso
dc.creatorCarolina V. Castilho
dc.creatorDavid Neill
dc.creatorFrancisco Dallmeier
dc.creatorLeandro Valle Ferreira
dc.creatorAlejandro Araujo Murakami
dc.creatorDaniel Praia
dc.creatorDário Dantas do Amaral
dc.creatorFernanda Antunes Carvalho
dc.creatorFernanda Coelho de Souza
dc.creatorKenneth Feeley
dc.creatorLuzmila Arroyo
dc.creatorDiogenes de Andrade Lima Filho
dc.creatorMarcelo Petratti Pansonato
dc.creatorRogerio Gribel
dc.creatorBoris Villa
dc.creatorJuan Carlos Licona
dc.creatorPaul V. A. Fine
dc.creatorCarlos Cerón
dc.creatorChris Baraloto
dc.creatorEliana M. Jimenez
dc.creatorJuliana Stropp
dc.creatorJulien Engel
dc.date.accessioned2024-09-11T17:48:35Z
dc.date.accessioned2025-09-09T00:56:47Z
dc.date.available2024-09-11T17:48:35Z
dc.date.issued2018
dc.description.abstractModelos de distribuição de espécies (SDMs) são amplamente utilizados em ecologia e conservação. SDMs somente de presença, como MaxEnt, frequentemente usam coleções de história natural (NHCs) como dados de ocorrência, devido aos seus enormes números e acessibilidade. NHCs são frequentemente espacialmente tendenciosos, o que pode gerar imprecisões em SDMs. Aqui, testamos como a distribuição de NHCs e previsões MaxEnt se relacionam com um modelo de abundância espacial, com base em um grande conjunto de dados de parcelas para espécies de árvores amazônicas, usando ponderação de distância inversa (IDW). Também propomos um novo pipeline para lidar com inconsistências em NHCs e limitar a área de ocupação das espécies. Encontramos uma relação positiva significativa, mas fraca, entre a distribuição de NHCs e IDW para 66% das espécies. A relação entre SDMs e IDW também foi significativa, mas fracamente positiva para 95% das espécies, e a sensibilidade para ambas as análises foi alta. Além disso, o pipeline removeu metade dos registros de NHCs. Os aplicativos SDM somente de presença devem considerar essa limitação, especialmente para grandes projetos de avaliações de biodiversidade, quando são gerados automaticamente sem verificação subsequente. Nosso pipeline fornece uma estimativa conservadora da área de ocupação de uma espécie, dentro de uma área ligeiramente maior do que sua extensão de ocorrência, compatível com, por exemplo, avaliações da lista vermelha da IUCN.
dc.format.mimetypepdf
dc.identifier.issn20452322
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/1843/76348
dc.languageeng
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.relation.ispartofScientific Reports
dc.rightsAcesso Aberto
dc.subjectEcologia
dc.subjectBiodiversidade
dc.subject.otherEcology
dc.subject.otherBiodiversity
dc.titleSpecies Distribution Modelling: Contrasting presence-only models with plot abundance data
dc.title.alternativeModelagem de distribuição de espécies: contrastando modelos somente de presença com dados de abundância de parcelas
dc.typeArtigo de periódico
local.citation.issue1
local.citation.volume8
local.description.resumoSpecies distribution models (SDMs) are widely used in ecology and conservation. Presence-only SDMs such as MaxEnt frequently use natural history collections (NHCs) as occurrence data, given their huge numbers and accessibility. NHCs are often spatially biased which may generate inaccuracies in SDMs. Here, we test how the distribution of NHCs and MaxEnt predictions relates to a spatial abundance model, based on a large plot dataset for Amazonian tree species, using inverse distance weighting (IDW). We also propose a new pipeline to deal with inconsistencies in NHCs and to limit the area of occupancy of the species. We found a significant but weak positive relationship between the distribution of NHCs and IDW for 66% of the species. The relationship between SDMs and IDW was also significant but weakly positive for 95% of the species, and sensitivity for both analyses was high. Furthermore, the pipeline removed half of the NHCs records. Presence-only SDM applications should consider this limitation, especially for large biodiversity assessments projects, when they are automatically generated without subsequent checking. Our pipeline provides a conservative estimate of a species’ area of occupancy, within an area slightly larger than its extent of occurrence, compatible to e.g. IUCN red list assessments.
local.publisher.countryBrasil
local.publisher.departmentICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS
local.publisher.initialsUFMG
local.url.externahttps://www.nature.com/articles/s41598-017-18927-1

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