Um estudo sobre o uso da geometria poligonal da cadeia principal como uma assinatura estrutural mais conservada que o empacotamento de resíduos

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dc.creatorJoao Arthur Ferreira Gadelha Campelo
dc.date.accessioned2019-08-14T06:31:05Z
dc.date.accessioned2025-09-09T00:55:25Z
dc.date.available2019-08-14T06:31:05Z
dc.date.issued2017-07-06
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/1843/BUOS-B5MKJ3
dc.languagePortuguês
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.rightsAcesso Aberto
dc.subjectBioinformática
dc.subjectProteinas Análise
dc.subjectProteinas Estrutura
dc.subject.otherAssinatura Estrutural
dc.subject.otherBioinformática
dc.subject.otherClassicador Estrutural
dc.titleUm estudo sobre o uso da geometria poligonal da cadeia principal como uma assinatura estrutural mais conservada que o empacotamento de resíduos
dc.typeTese de doutorado
local.contributor.advisor-co1Sabrina de Azevedo Silveira
local.contributor.advisor1Raquel Cardoso de Melo
local.description.resumoMesmo que a função não possa ser diretamente inferida puramente a partir do padrão de enovelamento especíco adotado por uma determinada proteína, os dados estruturais podem ser usados para detectar proteínas com funções semelhantes. Neste contexto, uma estratégia possível é a denição de assinaturas estruturais, que são conjuntos de características capazes de identicar inequivocamente um tipo de enovelamento proteico. O objetivo do corrente trabalho é encontrar possíveis padrões estruturais conservados em proteínas de mesma família. Para demonstrar que um modelo que utiliza as informações posicionais em nível atômico é conservado e discriminativo entre famílias, construiu-se classicadores estruturais. A partir deste estudo, foi possível discriminar os átomos do backbone como a melhor assinatura estrutural estudada. Inserindo pontos intermediários ctícios entre os carbonos alfa, obtêm-se uma poligonal geométrica, similar à poligonal geométrica obtida pela inclusão dos átomos da cadeia principal. Dessa forma, consegue-se um efeito similar à poligonal geométrica da cadeia principal sem a inuência do posicionamento dos átomos CeNe, indiretamente, sem a inuência dos ângulos phi e psi. O corrente estudo sugere que não são as posições desses átomos os fatores determinantes no incremento da precisão da classicação, mas o fortalecimento do caráter geométrico linear da cadeia principal. Portanto, a principal contribuição do presente trabalho é a investigação do uso da disposição geométrica poligonal da cadeia principal (ou dos próprios Cá, caso sejam adicionados pontos intermediários ctícios entre esses) como uma assinatura estrutural discriminativa.
local.publisher.initialsUFMG

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