Targeted next-generation sequencing and allele-specific quantitative PCR of laser capture microdissected samples uncover molecular differences in mixed odontogenic tumors

Abstract

A patogênese molecular dos tumores odontogênicos mistos não foi estabelecida, e a compreensão de sua base genética pode refinar sua classificação e ajudar a definir marcadores moleculares para fins diagnósticos. Mutações potencialmente patogênicas nos tecidos componentes de 28 casos de tumores odontogênicos mistos foram avaliadas. Tecido microdissecado por captura a laser de 10 fibromas ameloblásticos (AF), 4 fibrodentinomas ameloblásticos (AFD), 6 fibroodontomas ameloblásticos (AFO), 3 fibrossarcomas ameloblásticos (AFS) e 5 odontomas (OD) foram rastreados por sequenciamento de última geração e resultados confirmado por PCR quantitativo específico do alelo TaqMan. A mutação BRAF p.V600E no componente mesenquimal foi mostrada em 4 de 10 AF (40%), 2 de 4 AFD (50%), 2 de 6 AFO (33%) e 2 de 3 AFS (67%), enquanto todos os 5 OD eram do tipo selvagem para BRAF p.V600E. A mutação no componente epitelial foi observada apenas em um AF e um AFO. Um AFS continha uma área de FA benigna, e o componente mesenquimal de ambos (AFS e AF) continha BRAF p.V600E, apoiando o conceito de progressão maligna de um precursor de FA benigno. Polimorfismos de nucleotídeo único KDR, TP53, KIT e PIK3CA são relatados. Em conclusão, AF, AFD, AFO e AFS mostram BRAF p.V600E em seu componente mesenquimal, ao contrário de OD, que são do tipo BRAF selvagem, sugerindo que pelo menos um subconjunto de AF, AFD e AFO são molecularmente distintos de OD, e podem representar entidades distintas e ser neoplásicas.