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Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1843/36672
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dc.contributor.advisor1Gerald Weberpt_BR
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2390754751659201pt_BR
dc.contributor.referee1Ubirajara Agero Batistapt_BR
dc.contributor.referee2João Antônio Plascakpt_BR
dc.contributor.referee3Elso Drigo Filhopt_BR
dc.contributor.referee4Tauanne Dias Amarantept_BR
dc.creatorMateus Rodrigues Lealpt_BR
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/4421751952675132pt_BR
dc.date.accessioned2021-07-07T13:29:46Z-
dc.date.available2021-07-07T13:29:46Z-
dc.date.issued2021-01-29-
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/1843/36672-
dc.description.resumoO modelo Peyrard-Bishop (PB) é parte de um conjunto de modelos chamados mesoscópicos, que consiste em uma descrição clássica das interações moleculares com potenciais simples e que permite o cálculo da temperatura de desnaturação com eficiência em moléculas como o DNA e RNA. Nesse modelo, a dupla fita é considerada perfeitamente plana, ou seja, sem a caracterı́stica torção helicoidal e também não são considerados quaisquer parâmetros relaciconados à dimensão molecular. O modelo permite a integração trivial de um dos seus graus de liberdade, restando apenas um grau para ser resolvido por técnicas de integração numérica como a técnica de integral de transferência, razão pela qual é mais conhecido como modelo unidimensional (1D). Na Hamiltoniana original, o modelo produz uma curva de desnaturação muito suave enquanto seria esperado uma transição mais abrupta, o que requer a adição de termos não-lineares artificiais. As definições usadas na Hamiltoniana PB tornam bastante difı́cil a comparação dos seus resultados com os de técnicas microscópicas como dinâmica molecular atomı́stica. Desde a introdução do modelo em 1989, há um esforço em obter Hamiltonianas tridimensionais, mas, em geral, elas não são redutı́veis à equações 1D, isto é, a um modelo onde reste apenas uma dimensão a ser integrada pela técnica de integral de transferência. Obter um modelo tridimensional que possa ser reduzido a apenas uma dimensão integrável tem sido um problema em aberto. Nosso trabalho consistiu em fazer uma análise detalhada do modelo Peyrard-Bishop e elaborar um modelo tridimensional com caracterı́sticas geométricas mais próximas dos modelos atomı́sticos que o PB bidimensional. Desenvolvemos algumas aproximações que nos permitiram obter a redução da dimensão integrável, efetivamente obtendo um novo modelo 1D, e que nos permite utilizar a técnica de integral de transferência. Diferente do modelo oriundo da dimensão bidimensional, o novo modelo resulta em transições abruptas sem necessitar de potenciais artificialmente introduzidos. De fato, foi possı́vel demonstrar que as transições abruptas resultam diretamente por termos considerando três graus de liberdade. Para quantificar os efeitos das aproximações, realizamos a integração numérica da Hamiltoniana sem aproximação alguma. Com isso mostramos que o novo modelo é adequado à condição de pequenos ângulos que é similar à situação da fita dupla quando se encontra próximo à temperatura de desnaturação. Uma vantagem adicional do novo modelo é que pode ser aplicado sem modificação ao conjunto de técnicas desenvolvidas para sequências de DNA heterogêneas.pt_BR
dc.description.sponsorshipCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicopt_BR
dc.description.sponsorshipFAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Geraispt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Geraispt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentICX - DEPARTAMENTO DE FÍSICApt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Físicapt_BR
dc.publisher.initialsUFMGpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/3.0/pt/*
dc.subjectPeyrard-Bishoppt_BR
dc.subjectPeyrard-Bishop tridimensionalpt_BR
dc.subjectConvergênciapt_BR
dc.subjectDNApt_BR
dc.subjectIntegral de transferênciapt_BR
dc.subject.otherTermodinâmicapt_BR
dc.subject.otherDNApt_BR
dc.subject.otherInterações molecularespt_BR
dc.titleDesenvolvimento de modelos mesoscópicos tridimensionais para o estudo da desnaturação em DNApt_BR
dc.typeTesept_BR
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