Characterization of satellite DNAs in squirrel monkeys genus Saimiri (Cebidae, Platyrrhini)

Abstract

O gênero Saimiri é um quebra-cabeça taxonômico e filogenético de décadas para o qual a citogenética contribuiu com dados cruciais. Todas as espécies de Saimiri aparentemente têm um número diplóide de 2n = 44, mas variam no número de braços cromossômicos. Sequências repetitivas, como DNAs satélites, são marcadores citogenéticos potencialmente informativos porque apresentam altas taxas evolutivas. Nosso objetivo é aumentar os dados cariológicos pertinentes, caracterizando de forma mais completa as sequências de DNA satélite no gênero Saimiri. Conseguimos identificar dois DNAs satélites abundantes, alfa (~340 bp) e CapA (~1.500 pb), a partir de agrupamento de leitura curta de conjuntos de dados de sequenciamento de S. boliviensis. As sequências alfa compreendem cerca de 1% e a CapA 2,2% do genoma de S. boliviensis. Também mapeamos ambos os DNAs satélites em S. boliviensis, S. sciureus, S. vanzolinii e S. ustus. O alfa possui alta homogeneidade de repetição interespecífica e foi mapeado nos centrômeros de todas as espécies analisadas. CapA está associada à heterocromatina não pericentromérica e sua distribuição varia entre as espécies de Saimiri. Concluímos que a distribuição genômica do CapA e sua difusão em Platyrrhini o tornam um marcador citogenético atraente para Saimiri e outros macacos do Novo Mundo.