Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1843/76348
Type: Artigo de Periódico
Title: Species Distribution Modelling: Contrasting presence-only models with plot abundance data
Other Titles: Modelagem de distribuição de espécies: contrastando modelos somente de presença com dados de abundância de parcelas
Authors: Vitor H. F. Gomes
Dairon Cárdenas López
Marcos Silveira
Maria Cristina Peñuela Mora
Pascal Petronelli
Paul Maas
Raquel Thomas Caesar
Terry W. Henkel
Doug Daly
Marcos Ríos Paredes
Tim R. Baker
Alfredo Fuentes
Juan Ernesto Guevara
Carlos A. Peres
Jerome Chave
Jose Luis Marcelo Pena
Kyle G. Dexter
Miles R. Silman
Peter Møller Jørgensen
Toby Pennington
Anthony di Fiore
Fernando Cornejo Valverde
Juan Fernando Phillips
William E. Magnusson
Gonzalo Rivas Torres
Patricio Von Hildebrand
Tinde R. Van Andel
Ademir R. Ruschel
Adriana Prieto
Agustín Rudas
Bruce Hoffman
César I. A. Vela
Edelcilio Marques Barbosa
Egleé L. Zent
Oliver L. Phillips
George Pepe Gallardo Gonzales
Hilda Paulette Dávila Doza
Ires Paula de Andrade Miranda
Jean-louis Guillaumet
Linder Felipe Mozombite Pinto
Luiz Carlos de Matos Bonates
Natalino Silva
Ricardo Zárate Gómez
Stanford Zent
Therany Gonzales
Florian Wittmann
Vincent A. Vos
Yadvinder Malhi
Alexandre A. Oliveira
Angela Cano
Bianca Weiss Albuquerque
Corine Vriesendorp
Diego Felipe Correa
Emilio Vilanova Torre
Geertje Van Der Heijden
Hirma Ramirez-angulo
Marcelo de Jesus Veiga Carim
José Ferreira Ramos
Kenneth R. Young
Maira Rocha
Marcelo Trindade Nascimento
Maria Natalia Umaña Medina
Milton Tirado
Ophelia Wang
Rodrigo Sierra
Armando Torres-lezama
Casimiro Mendoza
Maria Pires Martins
Cid Ferreira
Cláudia Baider
Daniel Villarroel
Henrik Balslev
Italo Mesones
Ligia Estela Urrego Giraldo
Luisa Fernanda Casas
Manuel Augusto Ahuite Reategui
Reynaldo Linares Palomino
Roderick Zagt
Mariana Victória Irume
Sasha Cárdenas
William Farfan-rios
Adeilza Felipe Sampaio
Daniela Pauletto
Elvis H. Valderrama Sandoval
Freddy Ramirez Arevalo
Isau Huamantupa Chuquimaco
Karina Garcia Cabrera
Lionel Hernandez
Luis Valenzuela Gamarra
Daniel Sabatier
Miguel N. Alexiades
Susamar Pansini
Walter Palacios Cuenca
William Milliken
Joana Ricardo
Gabriela Lopez Gonzalez
Edwin Pos
Hans Ter Steege
Jean-françois Molino
Stéphanie D. Ijff
Olaf S. Bánki
José Renan da Silva Guimarães
Nigel C. A. Pitman
Maria Teresa Fernandez Piedade
Abel Monteagudo Mendoza
Bruno Garcia Luize
Eduardo Martins Venticinque
Evlyn Márcia Moraes de Leão Novo
Percy Núñez Vargas
Thiago Sanna Freire Silva
Niels Raes
Angelo Gilberto Manzatto
John Terborgh
Neidiane Farias Costa Reis
Juan Carlos Montero
Katia Regina Casula
Beatriz S. Marimon
Ben-hur Marimon
Euridice N. Honorio Coronado
Ted R. Feldpausch
Alvaro Duque
Iêda Leão Amaral
Charles Eugene Zartman
Nicolás Castaño Arboleda
Timothy J. Killeen
Bonifacio Mostacedo
Rodolfo Vasquez
Jochen Schöngart
Rafael L. Assis
Marcelo Brilhante Medeiros
Marcelo Fragomeni Simon
Ana Andrade
Rafael P. Salomão
William F. Laurance
José Luís Camargo
Layon O. Demarchi
Susan G. W. Laurance
Emanuelle de Sousa Farias
Henrique Eduardo Mendonça Nascimento
Juan David Cardenas Revilla
Adriano Quaresma
Flavia R. C. Costa
Ima Célia Guimarães Vieira
Luiz de Souza Coelho
Bruno Barçante Ladvocat Cintra
Hernán Castellanos
Roel Brienen
Pablo R. Stevenson
Yuri Feitosa
Joost F. Duivenvoorden
Gerardo A. Aymard C.
Hugo F. Mogollón
Natalia Targhetta
James A. Comiskey
Francisca Dionízia de Almeida Matos
Alberto Vicentini
Aline Lopes
Gabriel Damasco
Nállarett Dávila
Roosevelt García-villacorta
Carolina Levis
Juliana Schietti
Priscila Souza
Thaise Emilio
Alfonso Alonso
Carolina V. Castilho
David Neill
Francisco Dallmeier
Leandro Valle Ferreira
Alejandro Araujo Murakami
Daniel Praia
Dário Dantas do Amaral
Fernanda Antunes Carvalho
Fernanda Coelho de Souza
Kenneth Feeley
Luzmila Arroyo
Diogenes de Andrade Lima Filho
Marcelo Petratti Pansonato
Rogerio Gribel
Boris Villa
Juan Carlos Licona
Paul V. A. Fine
Carlos Cerón
Chris Baraloto
Eliana M. Jimenez
Juliana Stropp
Julien Engel
Abstract: Species distribution models (SDMs) are widely used in ecology and conservation. Presence-only SDMs such as MaxEnt frequently use natural history collections (NHCs) as occurrence data, given their huge numbers and accessibility. NHCs are often spatially biased which may generate inaccuracies in SDMs. Here, we test how the distribution of NHCs and MaxEnt predictions relates to a spatial abundance model, based on a large plot dataset for Amazonian tree species, using inverse distance weighting (IDW). We also propose a new pipeline to deal with inconsistencies in NHCs and to limit the area of occupancy of the species. We found a significant but weak positive relationship between the distribution of NHCs and IDW for 66% of the species. The relationship between SDMs and IDW was also significant but weakly positive for 95% of the species, and sensitivity for both analyses was high. Furthermore, the pipeline removed half of the NHCs records. Presence-only SDM applications should consider this limitation, especially for large biodiversity assessments projects, when they are automatically generated without subsequent checking. Our pipeline provides a conservative estimate of a species’ area of occupancy, within an area slightly larger than its extent of occurrence, compatible to e.g. IUCN red list assessments.
Abstract: Modelos de distribuição de espécies (SDMs) são amplamente utilizados em ecologia e conservação. SDMs somente de presença, como MaxEnt, frequentemente usam coleções de história natural (NHCs) como dados de ocorrência, devido aos seus enormes números e acessibilidade. NHCs são frequentemente espacialmente tendenciosos, o que pode gerar imprecisões em SDMs. Aqui, testamos como a distribuição de NHCs e previsões MaxEnt se relacionam com um modelo de abundância espacial, com base em um grande conjunto de dados de parcelas para espécies de árvores amazônicas, usando ponderação de distância inversa (IDW). Também propomos um novo pipeline para lidar com inconsistências em NHCs e limitar a área de ocupação das espécies. Encontramos uma relação positiva significativa, mas fraca, entre a distribuição de NHCs e IDW para 66% das espécies. A relação entre SDMs e IDW também foi significativa, mas fracamente positiva para 95% das espécies, e a sensibilidade para ambas as análises foi alta. Além disso, o pipeline removeu metade dos registros de NHCs. Os aplicativos SDM somente de presença devem considerar essa limitação, especialmente para grandes projetos de avaliações de biodiversidade, quando são gerados automaticamente sem verificação subsequente. Nosso pipeline fornece uma estimativa conservadora da área de ocupação de uma espécie, dentro de uma área ligeiramente maior do que sua extensão de ocorrência, compatível com, por exemplo, avaliações da lista vermelha da IUCN.
Subject: Ecologia
Biodiversidade
language: eng
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: Universidade Federal de Minas Gerais
Publisher Initials: UFMG
metadata.dc.publisher.department: ICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS
Rights: Acesso Aberto
URI: http://hdl.handle.net/1843/76348
Issue Date: 2018
metadata.dc.url.externa: https://www.nature.com/articles/s41598-017-18927-1
metadata.dc.relation.ispartof: Scientific Reports
Appears in Collections:Artigo de Periódico

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Species Distribution Modelling.pdfa.pdf713.96 kBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.