Whole-genome sequencing of the endemic Antarctic fungus Antarctomyces pellizariae reveals an ice-binding protein, a scarce set of secondary metabolites gene clusters and provides insights on Thelebolales phylogeny
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Universidade Federal de Minas Gerais
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O sequenciamento do genoma completo do fungo antártico endêmico Antarctomyces pellizariae revela uma proteína de ligação ao gelo, um conjunto escasso de aglomerados de genes de metabólitos secundários e fornece informações sobre a filogenia de Thelebolales
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Resumo
The snow-covered surfaces of Antarctica comprise an extreme environment that favors the development of life forms with adaptations to adverse low-temperature habitats. The ability to survive and such temperatures might involve the production of antifreeze proteins and ice-binding proteins that attenuate the effects of intense cold temperatures. He, we sequenced and reconstructed the nuclear and mitochondrial genomes of the endemic Antarctic fungus Antarctomyces pellizariae UFMGCB 12416. We then have identified a putative ice-binding protein-coding gene, mapped the presence of secondary metabolite gene clusters, and reconstructed the phylogenetic relationships of a A. pellizariae with others Leotiomycetes from the alignment of hundreds of orthologous single-copy proteins. Our results will deepen the understanding of microbial ice-binding proteins and the genomic aspects of psychrophilic fungi.
Abstract
As superfícies cobertas de neve da Antártica constituem um ambiente extremo que favorece o desenvolvimento de formas de vida com adaptações a habitats adversos de baixa temperatura. A capacidade de sobreviver a tais temperaturas pode envolver a produção de proteínas anticongelantes e proteínas de ligação ao gelo que atenuam os efeitos do frio intenso. Ele, nós sequenciamos e reconstruímos os genomas nuclear e mitocondrial do fungo antártico endêmico Antarctomyces pellizariae UFMGCB 12416. Em seguida, identificamos um suposto gene codificador de proteína de ligação ao gelo, mapeamos a presença de grupos de genes de metabólitos secundários e reconstruímos as relações filogenéticas de a A. pellizariae com outros Leotiomycetes a partir do alinhamento de centenas de proteínas ortólogas de cópia única. Nossos resultados aprofundarão a compreensão das proteínas microbianas de ligação ao gelo e os aspectos genômicos dos fungos psicrófilos.
Assunto
Extremófilos, Fungos, Baixas temperaturas, Genômica
Palavras-chave
Ice-binding protein, Extremophile, Psychrophilic, Thelebolales
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Endereço externo
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S088875431930816X?via%3Dihub