Whole-genome sequencing of the endemic Antarctic fungus Antarctomyces pellizariae reveals an ice-binding protein, a scarce set of secondary metabolites gene clusters and provides insights on Thelebolales phylogeny

dc.creatorThiago Mafra Batista
dc.creatorHeron Oliveira Hilário
dc.creatorGabriel Antônio Mendes de Brito
dc.creatorRennan Garcias Moreira
dc.creatorCarolina Furtado
dc.creatorGraciéle Cunha Alves de Menezes
dc.creatorCarlos Augusto Rosa
dc.creatorLuiz Henrique Rosa
dc.creatorGlória Regina Franco
dc.date.accessioned2023-03-24T20:41:17Z
dc.date.accessioned2025-09-09T00:19:02Z
dc.date.available2023-03-24T20:41:17Z
dc.date.issued2020
dc.description.abstractAs superfícies cobertas de neve da Antártica constituem um ambiente extremo que favorece o desenvolvimento de formas de vida com adaptações a habitats adversos de baixa temperatura. A capacidade de sobreviver a tais temperaturas pode envolver a produção de proteínas anticongelantes e proteínas de ligação ao gelo que atenuam os efeitos do frio intenso. Ele, nós sequenciamos e reconstruímos os genomas nuclear e mitocondrial do fungo antártico endêmico Antarctomyces pellizariae UFMGCB 12416. Em seguida, identificamos um suposto gene codificador de proteína de ligação ao gelo, mapeamos a presença de grupos de genes de metabólitos secundários e reconstruímos as relações filogenéticas de a A. pellizariae com outros Leotiomycetes a partir do alinhamento de centenas de proteínas ortólogas de cópia única. Nossos resultados aprofundarão a compreensão das proteínas microbianas de ligação ao gelo e os aspectos genômicos dos fungos psicrófilos.
dc.description.sponsorshipCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
dc.description.sponsorshipFAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais
dc.description.sponsorshipCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
dc.description.sponsorshipOutra Agência
dc.format.mimetypepdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1016/j.ygeno.2020.05.004
dc.identifier.issn1089-8646
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/1843/51223
dc.languageeng
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.relation.ispartofGenomics
dc.rightsAcesso Restrito
dc.subjectExtremófilos
dc.subjectFungos
dc.subjectBaixas temperaturas
dc.subjectGenômica
dc.subject.otherIce-binding protein
dc.subject.otherExtremophile
dc.subject.otherPsychrophilic
dc.subject.otherThelebolales
dc.titleWhole-genome sequencing of the endemic Antarctic fungus Antarctomyces pellizariae reveals an ice-binding protein, a scarce set of secondary metabolites gene clusters and provides insights on Thelebolales phylogeny
dc.title.alternativeO sequenciamento do genoma completo do fungo antártico endêmico Antarctomyces pellizariae revela uma proteína de ligação ao gelo, um conjunto escasso de aglomerados de genes de metabólitos secundários e fornece informações sobre a filogenia de Thelebolales
dc.typeArtigo de periódico
local.citation.epage2921
local.citation.issue5
local.citation.spage2915
local.citation.volume112
local.description.resumoThe snow-covered surfaces of Antarctica comprise an extreme environment that favors the development of life forms with adaptations to adverse low-temperature habitats. The ability to survive and such temperatures might involve the production of antifreeze proteins and ice-binding proteins that attenuate the effects of intense cold temperatures. He, we sequenced and reconstructed the nuclear and mitochondrial genomes of the endemic Antarctic fungus Antarctomyces pellizariae UFMGCB 12416. We then have identified a putative ice-binding protein-coding gene, mapped the presence of secondary metabolite gene clusters, and reconstructed the phylogenetic relationships of a A. pellizariae with others Leotiomycetes from the alignment of hundreds of orthologous single-copy proteins. Our results will deepen the understanding of microbial ice-binding proteins and the genomic aspects of psychrophilic fungi.
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-0755-1206
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-2548-1053
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-2775-1333
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-9427-1893
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-9749-5182
local.identifier.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-5245-2365
local.publisher.countryBrasil
local.publisher.departmentICB - DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA E IMUNOLOGIA
local.publisher.departmentICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA
local.publisher.departmentICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS
local.publisher.initialsUFMG
local.url.externahttps://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S088875431930816X?via%3Dihub

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