Ancestralidade genética e perfil de produção de citocinas em uma população de crianças brasileiras

dc.creatorHatilla dos Santos Silva
dc.date.accessioned2023-05-09T15:31:28Z
dc.date.accessioned2025-09-09T00:58:08Z
dc.date.available2023-05-09T15:31:28Z
dc.date.issued2022-07-05
dc.description.abstractThe profile of cytokines produced by CD4+ cells is an important marker of the type of immune response, for example, Th1 (IFN-γ), Th2 (Interleukin (IL)-5 and IL-13), and Treg (IL-10) responses. Furthermore, the immune response is considered a trait resulting from the interaction between environmental, genetic, and epigenetic factors. In this perspective, the genetic basis of the immunological components is a product of evolutionary processes that acted throughout human history, especially considering the diversity of environments faced throughout the dispersion of species. Thus, the present study aims to evaluate the influence of genomic ancestry on the production of IFN-γ (Th1), IL-5 (Th2), IL-13 (Th2), and IL-10 (Treg) cytokines in a Brazilian population. Study participants are children (4-11 years old) who are part of the SCAALA program (Social Change Asthma and Allergy in Latin America) in Salvador - Bahia. Global and local ancestry estimation was performed from genotyped variants using the Illumina Omni 2.5M chip. The production of cytokines was measured from the culture of blood cells through the immunoassay ELISA. The association between global ancestry and the production of cytokines was investigated using logistic regression, including potential confound variables. Admixture mapping for the IL-13 cytokine was performed using PLINK software. Here, we found an association between biogeographic genomic ancestry and production of the Th2 signature cytokine IL-13, in which individuals with greater African ancestry had a lower chance of producing IL3. A fine-mapping analysis reveals three variants (rs12598402-PLCG2 and rs28376615- CDH13, rs75929636-CDH13) associated with the production of IL-13. In addition, alleles of these three variants that were associated with a higher production of IL-13 were more frequent in individuals with greater African genetic influence in the genome. Future studies are needed to better elucidate the mechanisms associated with the regulation of Th2 response in the Brazilian population
dc.description.sponsorshipFAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/1843/52969
dc.languagepor
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.rightsAcesso Restrito
dc.subjectGenética
dc.subjectImunogenética
dc.subjectCélulas Th2
dc.subjectCitocinas
dc.subjectInterleucina - 13
dc.subject.otherImunogenética
dc.subject.otherTh2
dc.subject.otherIL-13
dc.subject.otherCitocinas
dc.subject.otherAncestralidade
dc.titleAncestralidade genética e perfil de produção de citocinas em uma população de crianças brasileiras
dc.title.alternativeGenetic ancestry and cytokine production profile in a Brazilian children population
dc.typeDissertação de mestrado
local.contributor.advisor-co1Camila Alexandrina Viana Figueiredo
local.contributor.advisor1Eduardo Martin Tarazona Santos
local.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/6203097295718656
local.contributor.referee1Alessandra Pontillo
local.contributor.referee1Marcelo Rizzatti Luizon
local.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/3900627959677705
local.description.embargo2025-12-31
local.description.resumoO perfil de citocinas produzido pelas células CD4+ é um marcador importante do tipo de resposta imune, por exemplo, as respostas Th1 (IFN-γ), Th2 (Interleucina (IL)-5 e IL-13) e Treg (IL-10). Ademais, a resposta imune é considerada um traço complexo resultante da interação entre fatores ambientais, genéticos e epigenéticos. Nesta perspectiva, a base genética dos componentes imunológicos é produto de processos evolutivos que atuaram ao longo da história humana, especialmente considerando a diversidade de ambientes encarada ao longo da dispersão da espécie. Assim, o presente trabalho tem como objetivo avaliar a influência da ancestralidade genômica na produção das citocinas IFN-γ (Th1), IL-5 (Th2), IL-13 (Th2) e IL-10 (Treg) em uma população brasileira. Os participantes do estudo são crianças (4 -11 anos) que fazem parte do programa SCAALA (Social Change Asthma and Allergy in Latin America) em Salvador - Bahia. Foi realizada a estimativa de ancestralidade global e local a partir de variantes genotipadas utilizando o chip Illumina Omni 2,5M. A produção das citocinas foi mensurada a partir da cultura de células sanguíneas por meio do imunoensaio ELISA. A associação entre ancestralidade global e produção de citocinas foi investigada por meio de regressão logística, incluindo variáveis potencialmente confundidoras. Foi realizado o mapeamento por miscigenação para a citocina IL-13 utilizando o software PLINK. Encontramos uma associação entre ancestralidade genômica biogeográfica e produção da citocina da assinatura Th2, IL-13, em que indivíduos com maior ancestralidade africana tiveram uma menor chance de serem produtores de IL-13. A análise posterior de mapeamento por miscigenação permitiu a identificação de três variantes intrônicas (rs12598402-PLCG2, rs28376615-CDH13 e rs75929636-CDH13) associadas com a produção de IL-13. Além disso, os alelos destas três variantes que estão associados a uma maior produção de IL-13 têm uma maior frequência em indivíduos com maior influência genética africana em seu genoma. Estudos futuros são necessários para melhor elucidação dos mecanismos associados à regulação da resposta Th2 na população Brasileira.
local.publisher.countryBrasil
local.publisher.departmentICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS
local.publisher.initialsUFMG
local.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Genética

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