Aplicações da genética na conservação e combate ao tráfico de animais silvestres
Carregando...
Data
Autor(es)
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Universidade Federal de Minas Gerais
Descrição
Tipo
Tese de doutorado
Título alternativo
Primeiro orientador
Membros da banca
Fábio José Viana Costa
Alvaro Cantini Nunes
Fernanda Antunes Carvalho
Alvaro Cantini Nunes
Fernanda Antunes Carvalho
Resumo
Diferentes abordagens na área da genética são capazes de auxiliar a conservação de espécies. Uma delas é através da identificação de animais silvestres ilegais em cativeiro. Além disto, recentemente, a resolução do CONAMA n° 487/2018 trouxe a obrigatoriedade de genotipagem de matrizes em criatórios para verificação de filiação para algumas espécies, sendo Saltator similis a espécie de maior prioridade devido à demanda do tráfico. Assim, este trabalho teve como principal foco o desenvolvimento de um teste de filiação para a espécie baseado em microssatélites e com uso da tecnologia de sequenciamento massivo de DNA (NGS) tanto para o desenvolvimento como para a análise dos marcadores. O teste de paternidade foi capaz de identificar os progenitores mesmo quando utilizado menos de dez loci, indicando que os loci desenvolvidos neste trabalho são bastante informativos e estão aptos a compor o painel de genotipagem, além de que também poderão ser usados em projetos de manejo e conservação. Adicionalmente, o mtDNA completo da espécie também foi sequenciado e anotado, e poderá auxiliar investigações de crimes contra a espécie quando a utilização apenas do COI não for informativa o suficiente e também em estudos evolutivos.
Outra abordagem é a biologia sintética, que pode auxiliar na manutenção de espécies reduzindo o risco de extinção e até mesmo criar espécies próximas às extintas, mas que mantenham a função ecológica no ecossistema. Um destes projetos pioneiros de de-extinction, no qual parte deste trabalho foi realizado, é a criação de um animal com genoma de elefante-asiático (espécie modelo) e mamute-lanoso, que mantenha as funções da espécie extinta. Para isso, é necessário conhecimento dos genomas das duas espécies e realização de edições gênicas. Assim, foram desenhados sgRNA para knockout de genes de elefante-asiático e primers para confirmação destas edições, além de padronização de protocolo de FISH para melhor entendimento da estrutura nuclear de mamute-lanoso. Concomitantemente, este tipo de projeto também costuma agir na preservação da espécie modelo, que, no caso do elefante-asiático, tem o vírus EEHV como um fator complicador na sua conservação. Ainda pouco se sabe sobre os mecanismos de patogenicidade deste vírus e possíveis tratamentos pois seu cultivo em laboratório ainda não foi possível. Visando possibilitar estes estudos, neste trabalho foram amplificados e extraídos fragmentos de EEHV para posterior construção do material genético do vírus que poderá ser utilizado em experimentos.
Abstract
Different approaches in the area of genetics are able to help species conservation.
One is through the identification of wild animals mantained illegally in captivity.
Recently the CONAMA resolution No. 487/2018 made the genotyping mandatory in
breeding facilities to verify the affiliation of some species, being Saltator similis the
species with the highest priority due to the demand for trafficking. Thus, this work had as
main focus the development of a paternity test for the species based on microsatellites
(STR) using the technology of massively parallel DNA sequencing both for the
development and for the analysis of the markers sequences. The paternity test was able
to identify the parents even when less than ten loci were used, indicating that the loci
developed in this work are very informative and are able to compose the genotyping
panel, in addition to the fact that they can also be used in management projects and
conservation. Additionally, the complete mtDNA of the species has also been sequenced
and annotated, and may assist investigations of crimes against the species when the use
of COI alone is not informative enough and also in evolutionary studies.
Another approach is synthetic biology, which can help maintain species by
reducing the risk of extinction and even creating proxies of extinct species that maintain
the ecological function in the ecosystem. One of these pioneering de-extinction projects,
in which part of this work was carried out, is the creation of a hybrid of Asian elephant
(template species) and woolly mammoth that maintains the ecological functions of the
extinct one. For this, it is necessary to know the genomes of both species and perform
gene editing. sgRNAs were designed to knockout Asian elephant genes and primers to
confirm these edits, as well as FISH protocol standardization for a better understanding
of the nuclear structure of woolly mammoth. At the same time, this type of project usually
helps in the preservation of template species. In the case of the Asian elephant, EEHV
infections have been a complicating factor in its conservation. Little is known about the
pathogenicity mechanisms of this virus and possible treatments because its cultivation in
the laboratory has not yet been possible. In order to make these studies possible, in this
work EEHV fragments were amplified and extracted for later construction of the virus
genetic material that could be used in experiments.
Assunto
Genética, Animais selvagens, Tráfico, Biologia Sintética
Palavras-chave
tráfico de animais silvestres, Saltator similis, microssatélites, de-extinction, biologia sintética