Caracterização da interação do domínio n-terminal da tetracenomicina ARO/CYC com ligantes por RMN
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Universidade Federal de Minas Gerais
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Resumo
A tetracenomicina aromatase/ciclase (TcmN) é uma enzima presente em Streptomyces glaucescens envolvida na ciclização, aromatização e enovelamento de policetídeos. Os policetídeos aromáticos são uma importante classe de metabólitos secundários produzidos por certas bactérias, fungos e plantas com várias atividades biológicas e farmaceuticas. Foi proposto um mecanismo no qual a termodinâmica e o equilíbrio conformacional da TcmN modulam sua função enzimática favorecendo a ligação do ligante e evitando a agregação da enzima. Existem poucos ensaios experimentais caracterizando a interação de TcmN com ligantes, e, para entender melhor o mecanismo catalítico da TcmN, esta pesquisa tem como objetivo investigar o mecanismo de reconhecimento molecular da TcmN com moléculas análogas a intermediários e ao produto, e compreender o papel da dinâmica conformacional da TcmN em sua função enzimática. A TcmN foi produzida por expressão heteróloga, purificada e preparada para as condições ideais experimentais. A interação com os ligantes foi avaliada por experimentos de ressonância magnética núclear (RMN) de relaxamento do 15N, de diferença de transferência de saturação por RMN (STD), perturbação de deslocamento químico 1H-15N (CSP) e simulações de dinâmica molecular (MD). O sítio de ligação da naringenina, mapeado por experimentos de CSP, localiza-se na cavidade central da TcmN. O complexo TcmN-naringenina foi modelado a partir das informações experimentais de CSP e STD. A dinâmica conformacional na escala de tempo μs-ms foi detectada por experimentos de relaxamento do 15N em resíduos da cavidade catalítica da TcmN em seu estado ligado com a naringenina. Dois confôrmeros predominantes representando os estados de cavidade aberta e fechada foram observados nas simulações de MD, e os resultados sugerem que a interação com o intermediário altera a população de conformação da TcmN para um estado aberto. Os resultados fornecem informações sobre a base molecular do reconhecimento de substrato e ajudam a delinear o mecanismo catalítico da TcmN.
Abstract
Assunto
Enzimas, Espectroscopia de ressonancia nuclear, Aromatase, Ciclização, Policetídeos, Tetraciclina
Palavras-chave
Dinâmica, Policetídeos, Tetracenomicina aromatase/ciclase TcmN
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https://proceedings.science/jornada-auremn-2022/trabalhos/caracterizacao-da-interacao-do-dominio-n-terminal-da-tetracenomicina-arocyc-com?lang=pt-br