Emprego do eDNA metabarcoding na investigação da biodiversidade de peixes de um reservatório urbano
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Editor
Universidade Federal de Minas Gerais
Descrição
Tipo
Dissertação de mestrado
Título alternativo
Using eDNA metabarcoding to investigate the biodiversity of fish in an urban reservoir
Primeiro orientador
Membros da banca
Bruno Henrique Saranholi
Patricia Sanae Sujii
Patricia Sanae Sujii
Resumo
O monitoramento da biodiversidade em ambientes aquáticos é fundamental para a conservação
dos ecossistemas e para o manejo sustentável dos recursos naturais. A utilização de métodos
não invasivos, como o metabarcoding de DNA ambiental (eDNA), tem se mostrado uma
alternativa eficaz e promissora para o estudo da diversidade de espécies aquáticas. Neste
contexto, neste projeto desenvolvemos protocolos de eDNA metabarcoding para o
monitoramento da ictiofauna na Lagoa dos Ingleses, um reservatório artificial de água doce na
região Neotropical. Além disso, comparamos metodologias distintas de coleta de DNA
ambiental e avaliamos sua efetividade para elucidação da biodiversidade. A escolha da Lagoa
dos Ingleses, localizada em Nova Lima, Minas Gerais, Brasil, como modelo para o
aperfeiçoamento do monitoramento de peixes é estratégica, pois é um local de fácil acesso com
uma ictiofauna reduzida. Os resultados indicam que a metodologia tem a capacidade de realizar
a identificação de espécies nativas, endêmicas e introduzidas, além de fornecer informações
sobre a variação temporal e espacial da ocorrência de espécies no reservatório. Identificamos
44 espécies, pertencentes a 39 gêneros e 22 famílias. Observamos que a escolha do protocolo
de monitoramento influencia nos resultados, com os filtros Sterivex recuperando a identificação
de mais espécies, mesmo com menor volume de água filtrada. O desenho amostral empregado
foi crucial, pois a variação espacial e temporal das espécies exigiu monitoramento de múltiplos
pontos em diferentes temporadas para uma obtenção mais completa da biodiversidade do
reservatório.
Abstract
Biodiversity monitoring in aquatic environments is essential for ecosystem conservation and
sustainable natural resource management. The use of non-invasive methods, such as
environmental DNA (eDNA) metabarcoding, has emerged as an effective and promising
alternative for studying aquatic species diversity. In this context, this project developed eDNA
metabarcoding protocols for monitoring fish fauna in Lagoa dos Ingleses, a Neotropical
freshwater artificial lake.. We also compared different eDNA collection methodologies and
assessed their effectiveness for biodiversity elucidation. The choice of Lagoa dos Ingleses, an
artificial lake located in Nova Lima, Minas Gerais, Brazil, as a model for improving fish
monitoring is strategic, as it is an easily accessible site with a reduced fish fauna. The results
indicate that the methodology can identify native, endemic, and introduced species, and provide
information on the temporal and spatial variation of species occurrence in the reservoir. We
identified 44 possible species, belonging to 39 genera and 22 families. We observed that the
choice of the monitoring protocol influences the results, with Sterivex filters recovering the
identification of more species, even with a smaller volume of filtered water. The sampling
design employed was crucial, as the spatial and temporal variation of the species required
monitoring of multiple points in different seasons to obtain a more complete picture of the
reservoir's biodiversity.
Assunto
Genética, Monitoramento Biológico, DNA ambiental, Osteichthyes
Palavras-chave
Região Neotropical, Biomonitoramento, DNA Ambiental, Ictiofauna, Reservatório Urbano, Metabarcoding