Validação da associação da variante rs114066381 (de origem africana e potencialmente reguladora) com obesidade em mulheres
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Universidade Federal de Minas Gerais
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Tipo
Dissertação de mestrado
Título alternativo
Validation of the association of the rs114066381 variant (of African origin and potentially regulatory) with obesity in women
Primeiro orientador
Membros da banca
Janaína de Oliveira Melo
Maria Raquel Santos Carvalho
Maria Raquel Santos Carvalho
Resumo
A obesidade é uma doença de caráter multifatorial com grande prevalência nacional e mundial e têm apresentado aumento de casos nas últimas décadas. O IMC (Índice de Massa Corporal) é uma das formas mais usadas para classificação de indivíduos e identificação de casos da doença (IMC>30kg/m2) (OMS, 2000a), apesar de suas limitações. No contexto de populações miscigenadas, como a brasileira, a técnica de mapeamento por miscigenação se apresenta como uma alternativa promissora de identificação de novas variantes genéticas relacionadas a fenótipos complexos, como a obesidade, em relação aos estudos de associação tradicionais. Nesta conjuntura, Scliar et al. (2021) identificaram a variante rs114066381G>A associada positivamente com o IMC em mulheres de ancestralidade africana. Como este resultado foi obtido a partir de dados imputados, que apresentam grau de incerteza inerente, este trabalho teve como objetivo avaliar a associação de rs114066381 com o IMC a partir da genotipagem de mulheres com obesidade em tratamento no Hospital das Clínicas da Universidade Federal de Minas Gerais e no Hospital Santa Casa Belo Horizonte. As coortes de Bambuí e Pelotas do EPIGEN, analisadas em Scliar et al. (2021), foram utilizadas para comparação. A partir de teste de associação exato de Fisher, replicamos o resultado de Scliar et al. (2021) utilizando a coorte de Pelotas e as duas coortes do EPIGEN em conjunto com valores significativos de RC (Razão de Chance) respectivos de 4,07 e 3,73. Não foi possível replicar a associação na coorte de Bambuí possivelmente por baixo tamanho amostral. Dessa forma, a variante rs114066381 pode ser uma nova variante fortemente relacionada à obesidade, sendo necessários futuros estudos funcionais que possam revelar seu possível mecanismo funcional.
Abstract
Obesity is a multifactorial disease with high national and global prevalence and there is
an increase in cases in recent decades. BMI (Body Mass Index) is one of the most used
ways to classify individuals and identify cases of the disease (BMI>30kg/m2) (WHO,
2000a), despite its limitations. In the context of mixed populations, such as Brazil, the
admixture mapping technique is a promising alternative for identifying new genetic
variants related to complex phenotypes, such as obesity, in comparison to traditional
association studies. In this circumstance, Scliar et al. (2021) identified the
rs114066381G>A variant positively associated with BMI in women of African
ancestry. As this result was obtained from imputed data, which presents a degree of
inherent uncertainty, this work aimed to evaluate the association of rs114066381 with
BMI based on genotyping of women with obesity and undergoing treatment at the
Hospital das Clínicas of the Federal University of Minas Gerais and at Hospital Santa
Casa Belo Horizonte. The EPIGEN Bambuí and Pelotas cohorts, analyzed in Scliar et
al. (2021), were used for comparison. Using Fisher's exact association test, we
replicated the results of Scliar et al. (2021) using both the Pelotas cohort and the two
cohorts in conjunction as a control with respective significant OR values (Odds Ratio) of
4.07 and 3.73. It was not possible to replicate the association in the Bambuí
cohort, possibly due to a low sample size. Thus, the rs114066381 variant could be a
new variant strongly related to obesity, requiring future functional studies that could
reveal its possible functional mechanism.
Assunto
Genética Populacional, Miscigenação, Obesidade
Palavras-chave
obesidade, mapeamento por miscigenação, populações miscigenadas