Polimorfismos no gene dupA de Helicobacter pylori e risco de úlcera duodenal e carcinoma gástrico
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Universidade Federal de Minas Gerais
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Dissertação de mestrado
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Resumo
O dupA (“duodenal ulcer promoting gene A”) é constituído por dois genes homólogos
ao virB4, jhp0917 e jhp0918, que pela inserção de uma base T ou C depois da
posição 1385 da região 3’ do jhp0917, forma um gene único de 1839 pares de
bases. O gene foi descrito como um provável marcador de virulência do H. pylori
associado exclusivamente à úlcera péptica duodenal em pacientes asiáticos.
Entretanto, a pesquisa desse marcador em linhagens isoladas de diferentes
populações tem mostrado grande variação na associação com doenças. No Brasil, a
prevalência de linhagens consideradas dupA-positivas por PCR é muito alta e a
presença do gene não tem sido associada com as doenças decorrentes da infecção
pelo H. pylori. As diferenças observadas na literatura podem-se dever à detecção
apenas parcial do gene, quando métodos usuais são usados, visto que
polimorfismos que criam stop codon prematuros têm sido descritos. O objetivo desse
estudo foi investigar, por sequenciamento gênico, a presença de polimorfismos em
toda a extensão do gene dupA de amostras de H. pylori isoladas de pacientes com
gastrite (n=26), úlcera duodenal (n=29) e carcinoma gástrico (n=20), usando a
metodologia de Primer Walking. Das 75 amostras, 41 (54,7%) não apresentaram
polimorfismos que geram stop codons à montante da posição 1839 e foram
consideradas dupA-intactas. Por outro lado, 34 (45,3%) amostras apresentaram um
ou mais polimorfismos que criam stop codons prematuros, rompendo o gene em
produtos menores que o descrito como sendo dupA. A presença de dupA intacto foi
mais frequentemente observada nas amostras isoladas de pacientes com úlcera
duodenal [n=19 (65,5%)] que naquelas de pacientes com gastrite [n=12 (46,2%)] ou
carcinoma gástrico [n=10 (50%)]. Na análise logística, ajustando para sexo e idade,
a presença de dupA intacto associou-se independentemente com úlcera duodenal
(p=0,02; OR=5,06; IC 95%=1,22 - 20,96), indicando que o gene é um fator de risco
para a doença na nossa população.
Abstract
The dupA (“duodenal ulcer promoting gene A”) is constituted by two virB4 genes,
jhp0917 and jhp0918, that forms one single gene of 1839 base pairs when there is
an insertion of a T or C base after the position 1385 of the jhp0917 3’ region. The
gene was described as a putative virulence marker of H. pylori associated exclusively
with duodenal peptic ulcer in Asiatic patients. However, the study of this marker in
strains isolated from different populations has showed wide variation in its
association with diseases. In Brazil, the prevalence of strains considered to be dupA
positive by PCR is too high and the presence of the gene has not been associated
with the diseases associated with H. pylori infection. The differences observed in the
literature may be due to the detection of only part of the gene, when conventional
methods are used, since polymorphisms that create premature stop codon have
been described. The aim of this study was to investigate, by gene sequencing, the
presence of polymorphisms in the entire extension of the dupA gene from H. pylori
strains isolated from patients with gastritis (n=26), duodenal ulcer (n=29) and gastric
carcinoma (n=20), using the methodology of Primer Walking. From the 75 strains, 41
(54.7%) did not have polymorphisms that create stop codons before the 1839
position and were considered as dupA-intact. On the other hand, 34 (45.3%) strains
had one or more polymorphisms that create premature stop codons, splitting the
gene in smaller products than the one described as dupA. The presence of the intact
dupA was more frequently observed in strains isolated from patients with duodenal
ulcer [n=19 (65.5%)] than those from patients with gastritis [n=12 (46.2%)] or gastric
carcinoma [n=10 (50%)]. In logistic analysis, adjusting for gender and age, the
presence of intact dupA independently associated with duodenal ulcer (p=0.02,
OR=5.06, IC 95%=1.22 – 20.96), indicating that the gene is a risk factor for the
disease in our population.
Assunto
Microbiologia, Helicobacter pylori, Polimorfismo Genético
Palavras-chave
Helicobacter pylori, dupA, Polimorfismos