Identification and characterization of a subtelomeric satellite DNA in Callitrichini monkeys
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Universidade Federal de Minas Gerais
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Identificação e caracterização de um DNA satélite subtelomérico em Macacos Callitrichini
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Resumo
Repetitive DNAs are abundant fast-evolving components of eukaryotic genomes, which often
possess important structural and functional roles. Despite their ubiquity, repetitive DNAs are
poorly studied when compared with the genic fraction of genomes. Here, we took advantage of
the availability of the sequenced genome of the common marmoset Callithrix jacchus to assess
its satellite DNAs (satDNAs) and their distribution in Callitrichini. After clustering analysis of all
reads and comparisons by similarity, we identified a satDNA composed by 171 bp motifs,
named MarmoSAT, which composes 1.09% of the C. jacchus genome. Fluorescent in situ hybridization on chromosomes of species from the genera Callithrix, Mico and Callimico showed
that MarmoSAT had a subtelomeric location. In addition to the common monomeric, we found
that MarmoSAT was also organized in higher-order repeats of 338 bp in Callimico goeldii. Our
phylogenetic analyses showed that MarmoSAT repeats from C. jacchus lack chromosomespecific features, suggesting exchange events among subterminal regions of non-homologous
chromosomes. MarmoSAT is transcribed in several tissues of C. jacchus, with the highest transcription levels in spleen, thymus and heart. The transcription profile and subtelomeric location
suggest that MarmoSAT may be involved in the regulation of telomerase and modulation of
telomeric chromatin.
Abstract
DNAs repetitivos são componentes abundantes e de rápida evolução dos genomas eucarióticos, que muitas vezes
possuem importantes funções estruturais e funcionais. Apesar de sua onipresença, DNAs repetitivos são
pouco estudado quando comparado com a fração gênica dos genomas. Aqui aproveitamos
a disponibilidade do genoma sequenciado do sagui comum Callithrix jacchus para avaliar
seus DNAs satélites (satDNAs) e sua distribuição em Callitrichini. Após a análise de agrupamento de todos
leituras e comparações por similaridade, identificamos um satDNA composto por motivos de 171 pb,
denominado MarmoSAT, que compõe 1,09% do genoma de C. jacchus. A hibridização in situ fluorescente em cromossomos de espécies dos gêneros Callithrix, Mico e Callimico mostrou
que o MarmoSAT tinha uma localização subtelomérica. Além do monomérico comum, encontramos
que o MarmoSAT também foi organizado em repetições de ordem superior de 338 pb em Callimico goeldii. Nosso
análises filogenéticas mostraram que as repetições MarmoSAT de C. jacchus carecem de características cromossômicas específicas, sugerindo eventos de troca entre regiões subterminais de células não homólogas
cromossomos. MarmoSAT é transcrito em diversos tecidos de C. jacchus, com os maiores níveis de transcrição no baço, timo e coração. O perfil de transcrição e localização subtelomérica
sugerem que o MarmoSAT pode estar envolvido na regulação da telomerase e na modulação da
cromatina telomérica.
Assunto
Heterocromatina, DNA
Palavras-chave
Heterochromatin, Repetitive Sequences, Nucleic Acid, Platyrrhini
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https://academic.oup.com/dnaresearch/article/24/4/377/3977795?login=true