Identification and characterization of a subtelomeric satellite DNA in Callitrichini monkeys

dc.creatorNaiara Pereira Araújo
dc.creatorLeonardo Gomes de Lima
dc.creatorGuilherme Borges Dias
dc.creatorGustavo Campos e Silva Kuhn
dc.creatorAlan Lane de Melo
dc.creatorYatiyo Yonenaga-yassuda
dc.creatorRoscoe Stanyon
dc.creatorMarta Svartman
dc.date.accessioned2024-07-31T21:52:00Z
dc.date.accessioned2025-09-09T00:01:15Z
dc.date.available2024-07-31T21:52:00Z
dc.date.issued2017
dc.description.abstractDNAs repetitivos são componentes abundantes e de rápida evolução dos genomas eucarióticos, que muitas vezes possuem importantes funções estruturais e funcionais. Apesar de sua onipresença, DNAs repetitivos são pouco estudado quando comparado com a fração gênica dos genomas. Aqui aproveitamos a disponibilidade do genoma sequenciado do sagui comum Callithrix jacchus para avaliar seus DNAs satélites (satDNAs) e sua distribuição em Callitrichini. Após a análise de agrupamento de todos leituras e comparações por similaridade, identificamos um satDNA composto por motivos de 171 pb, denominado MarmoSAT, que compõe 1,09% do genoma de C. jacchus. A hibridização in situ fluorescente em cromossomos de espécies dos gêneros Callithrix, Mico e Callimico mostrou que o MarmoSAT tinha uma localização subtelomérica. Além do monomérico comum, encontramos que o MarmoSAT também foi organizado em repetições de ordem superior de 338 pb em Callimico goeldii. Nosso análises filogenéticas mostraram que as repetições MarmoSAT de C. jacchus carecem de características cromossômicas específicas, sugerindo eventos de troca entre regiões subterminais de células não homólogas cromossomos. MarmoSAT é transcrito em diversos tecidos de C. jacchus, com os maiores níveis de transcrição no baço, timo e coração. O perfil de transcrição e localização subtelomérica sugerem que o MarmoSAT pode estar envolvido na regulação da telomerase e na modulação da cromatina telomérica.
dc.format.mimetypepdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1093/dnares/dsx010
dc.identifier.issn13402838
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/1843/72235
dc.languageeng
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.relation.ispartofDNA Research
dc.rightsAcesso Aberto
dc.subjectHeterocromatina
dc.subjectDNA
dc.subject.otherHeterochromatin
dc.subject.otherRepetitive Sequences, Nucleic Acid
dc.subject.otherPlatyrrhini
dc.titleIdentification and characterization of a subtelomeric satellite DNA in Callitrichini monkeys
dc.title.alternativeIdentificação e caracterização de um DNA satélite subtelomérico em Macacos Callitrichini
dc.typeArtigo de periódico
local.citation.epage385
local.citation.issue4
local.citation.spage377
local.citation.volume24
local.description.resumoRepetitive DNAs are abundant fast-evolving components of eukaryotic genomes, which often possess important structural and functional roles. Despite their ubiquity, repetitive DNAs are poorly studied when compared with the genic fraction of genomes. Here, we took advantage of the availability of the sequenced genome of the common marmoset Callithrix jacchus to assess its satellite DNAs (satDNAs) and their distribution in Callitrichini. After clustering analysis of all reads and comparisons by similarity, we identified a satDNA composed by 171 bp motifs, named MarmoSAT, which composes 1.09% of the C. jacchus genome. Fluorescent in situ hybridization on chromosomes of species from the genera Callithrix, Mico and Callimico showed that MarmoSAT had a subtelomeric location. In addition to the common monomeric, we found that MarmoSAT was also organized in higher-order repeats of 338 bp in Callimico goeldii. Our phylogenetic analyses showed that MarmoSAT repeats from C. jacchus lack chromosomespecific features, suggesting exchange events among subterminal regions of non-homologous chromosomes. MarmoSAT is transcribed in several tissues of C. jacchus, with the highest transcription levels in spleen, thymus and heart. The transcription profile and subtelomeric location suggest that MarmoSAT may be involved in the regulation of telomerase and modulation of telomeric chromatin.
local.publisher.countryBrasil
local.publisher.departmentICB - DEPARTAMENTO DE PARASITOLOGIA
local.publisher.initialsUFMG
local.url.externahttps://academic.oup.com/dnaresearch/article/24/4/377/3977795?login=true

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